差别

这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。

--- adf:vandervaalsofband [2023/09/21 10:10] – [结果查看] liu.jun
+++ adf:vandervaalsofband [2023/09/21 12:07] (当前版本) – [结果查看] liu.jun
@@ 行 1: / 行 1: @@
 ======如何显示周期性体系范德华表面的静电势分布======
-首先，范德华表面的定义，如果参考文献（J. Am. Chem. Soc. 1987, 109,7968-7979）的定义，则可以选为电子云密度等值面的值为0.001的曲面。
+首先，范德华表面的定义，如果参考文献（J. Am. Chem. Soc. 1987, 109,7968-7979）的定义，则可以选为电子云密度等值面的值为 0.001 a.u. 的曲面。
-然后在该曲面显示静电势或其他函数均可。任何一个单点计算，均可给出该性质。本文是关于BAND模块针对周期性体系的计算，单点计算参数设置，参考：[[adf:singlepoint_band]]，不需要勾选能带、态密度相关计算。
+然后在该曲面显示静电势或其他函数均可。任何一个单点计算，均可给出该性质。本文是关于 BAND 模块针对周期性体系的计算，单点计算参数设置，参考：[[adf:singlepoint_band]]，不需要勾选能带、态密度相关计算。
 ======结果查看=====
-这里我们显示总电子密度0.001 au的等值面上，静电势的分布情况。操作方法：SCM LOGO → View → Add → Isosurface:colored:
+这里我们显示总电子密度0.001 a.u. 的等值面上，静电势的分布情况。操作方法：
-{{ :adf:vandervaasrssurfaceband01.png?650 |}}
+BAND 显示的静电势符号需要反号，即乘以 -1：
+  - 菜单栏Field - Calculate - 窗口底部选择计算符号为“*(Scalar)” ，左侧输入-1.0，右侧选择Potential - Couloumb Potential，从而生成 C-1 函数即真正的静电势
+  - 显示该 C-1 函数：
+    - Restricted 计算的结果：Add → Isosurface:colored，窗口底部左边的 Select Field 选择密度等值面：Density - total density，窗口底部右边的 Select Field 选择 Other → C-1，并勾选右下角的 Bar（色条显示）
+    -Unrestricted 计算的结果：软件生成的电子密度是 Density A → Total Density A 和 Density B → Total Density B两个函数，即 α 电子密度、β 电子密度，这里我们将二者加和得到总电子密度<color lightgrey>（Field - Calculate - 左边的 Select Field 选择 Density A → Total Density A，右边的 Select Field 选择 Density B → Total Density B，中间的减号改为加号）</color>名为 C-2。Add → Isosurface:colored，窗口底部左边的 Select Field 选择电子密度等值面：Other → C-2，窗口底部右边的 Select Field 选择静电势 Other → C-1，并勾选右下角的 Bar（色条显示）
-注意：
+半透明显示的设置：点击窗口底部，要修改半透明显示的那个函数对应的 Isosurface: * 按钮 - Show details，然后将Opacity从默认 100 改为50（值越小透明度越低，100为不透明，0为完全透明）
-  - 窗口底部 Select Field，左边选择 Density - total density（如果是 Unrestricted 计算，则分别生成 Density A 和 Density B，即 α 电子密度、β 电子密度，可以将二者加和得到总电子密度，然后此处选择总电子密度即可。关于加和的操作，参考：[[adf:adfviewcalculate]]），指电子云密度，0.001即该曲面为电子云密度值为0.001 a.u.的曲面
+具体如下图所示：
-  - 窗口底部右边Select Field选择potential - coulomb potential，即静电势，后面两个方框内的值为该曲面上静电势的范围
+===Restricted 计算的结果===
-  - 可以点击左下角第一个选项，选择Show details，设置Opacity的值为40~50左右，该数值为透明度，0表示完全透明，100表示完全不透明
+{{ :adf:bandcoulomb04.png?750 |}}
-  - 勾选最右侧的Bar，则显示色条
+<color blue>注意：总电子密度等值面的值应为0.001 a.u，这里应该把 Total Density 后面默认的0.03改为0.001。</color>
+===Unrestricted 计算的结果===
+{{ :adf:colombpotentialofbandtmp.png?750 |}}
+<color blue>注意：总电子密度等值面的值应为0.001 a.u，这里应该把 C-2 后面默认的0.03改为0.001。</color>

费米维基

用户工具

站点工具

差别

页面工具