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adf:vandervaalsofband [2023/06/14 15:41] – [结果查看] liu.jun | adf:vandervaalsofband [2023/09/21 12:07] (当前版本) – [结果查看] liu.jun | ||
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======如何显示周期性体系范德华表面的静电势分布====== | ======如何显示周期性体系范德华表面的静电势分布====== | ||
- | 首先,范德华表面的定义,如果参考文献(J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, | + | 首先,范德华表面的定义,如果参考文献(J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, |
- | 然后在该曲面显示静电势或其他函数均可。任何一个单点计算,均可给出该性质。本文是关于BAND模块针对周期性体系的计算,单点计算参数设置,参考:[[adf: | + | 然后在该曲面显示静电势或其他函数均可。任何一个单点计算,均可给出该性质。本文是关于 BAND 模块针对周期性体系的计算,单点计算参数设置,参考:[[adf: |
======结果查看===== | ======结果查看===== | ||
- | 操作方法:SCM LOGO → View → Add → Isosurface: | + | 这里我们显示总电子密度0.001 a.u. 的等值面上,静电势的分布情况。操作方法: |
- | {{ :adf:vandervaasrssurfaceband01.png? | + | BAND 显示的静电势符号需要反号,即乘以 -1: |
+ | - 菜单栏Field - Calculate - 窗口底部选择计算符号为“*(Scalar)” ,左侧输入-1.0,右侧选择Potential - Couloumb Potential,从而生成 C-1 函数即真正的静电势 | ||
+ | - 显示该 C-1 函数: | ||
+ | - Restricted 计算的结果:Add → Isosurface:colored,窗口底部左边的 Select Field 选择密度等值面:Density - total density,窗口底部右边的 Select Field 选择 Other → C-1,并勾选右下角的 Bar(色条显示) | ||
+ | -Unrestricted 计算的结果:软件生成的电子密度是 Density A → Total Density A 和 Density B → Total Density B两个函数,即 α 电子密度、β 电子密度,这里我们将二者加和得到总电子密度< | ||
- | 注意: | + | 半透明显示的设置:点击窗口底部,要修改半透明显示的那个函数对应的 Isosurface: * 按钮 |
- | - 窗口底部Select Field,左边选择Density | + | 具体如下图所示: |
- | - 窗口底部右边Select Field选择potential - coulomb potential,即静电势,后面两个方框内的值为该曲面上静电势的范围 | + | ===Restricted 计算的结果=== |
- | - 可以点击左下角第一个选项,选择Show details,设置Opacity的值为40~50左右,该数值为透明度,0表示完全透明,100表示完全不透明 | + | {{ : |
- | | + | <color blue> |
+ | ===Unrestricted 计算的结果=== | ||
+ | {{ : | ||
+ | <color blue> |