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sw:simpleware_自动分割

Simpleware 自动分割

Simpleware 自动分割工具旨在解决通常需要大量手动交互的分割挑战,AS Ortho 和 AS Cardio 模块可以通过全自动地一键点击执行分割取代。

注:此功能仅供研究使用。根据美国 FDA 510(k)或欧盟 CE 认证,它尚未被批准用作医疗器械。

对于DICOM图像,患者的方位是自动确定的。然而,如果背景中不包含 DICOM 标签,则必须对其进行定向,使 X 方向增至患者左侧,Y 方向增至后侧,Z 方向增至上侧。背景 CT 图像的灰度值单位必须是 Hounsfield Units(HU)。

AS Ortho 骨科

AS Ortho:专为骨科设计的自动分割工具,支持处理的数据包含髋关节 CT、膝关节 CT、脊柱 CT、髋关节翻修 CT、踝关节 CT、膝关节 MRI、肩部 CT、颅颌面 CT。

髋关节 CT

感兴趣区域的选取

CT 扫描数据通常包含一个大于髋关节/骨盆的区域,Hip CT 工具的处理速度会受到感兴趣区域(Region of Interest,ROI)内所包含体积的影响。ROI 可以自动选择,也可以手动指定。在大多数情况下,建议自动选择。Automatic(hip region) 选项只选择髋关节周围的区域,会产生最快的结果,只有股骨近端部分会被分割出来。Automatic(part selection) 运行速度较慢,将会分割图示中所选部位的全部范围。Manual 选项可以手动定义 ROI,点击 Edit 按钮在 Region of interest 对话框调整范围。

分割部位

  • 骶骨
  • 髋关节(右)
  • 髋关节(左)
  • 股骨近端(右)
  • 股骨近端(左)

点击工具面板中图示对应解剖结构的位置即可切换该部位分割的开启和关闭(关闭时为浅色),默认将对所有部位进行分割。

标志点标注

该工具可以自动创建关键的解剖标志。如果勾选 Create landmarks。将创建以下标志点:

  • 股骨近端(右/左)
    • 小转子(右/左)
    • 大转子(右/左)
    • 股骨头中心(右/左)
  • 髋关节(右/左)
    • 耻骨结节(右/左)
    • 髂前上棘(右/左)
    • 髂后上棘(右/左)
  • 骶骨
    • 尾骨

保留所有骨头碎片

如果 Keep all bone fragments 未被勾选(默认),则每个骨骼将只保留最大的碎片(孤岛)。建议在骨骼完好的非外伤病例中保持不勾选这一选项。

如果勾选 Keep all bone fragments,该工具将输出每个骨骼的所有检测区域,这些区域可能由多个碎片(孤岛)组成。对于创伤图像或存在明显金属伪影的图像,建议勾选该选项。该工具还可能输出需要手动去除的孤岛。

扫描要求

以下为测试该工具所用图像数据信息和分割运行时间(3 分 30 秒)参考。

  • 较大的间距(较低的分辨率)可能会产生不太准确的结果;较小的间距(较高的分辨率)可能不会带来额外的好处。
  • 测试软件版本:V-2024.06
  • 测试运行设备:Quadro T1000 GPU

膝关节 CT

分割部位

  • 股骨
  • 胫骨
  • 腓骨
  • 髌骨
  • 腓肠豆

标志点标注

  • 股骨
    • 外侧/内侧髁
    • 远端外侧/内侧髁
    • 肱骨外/内上髁
    • 近端轴中心
  • 胫骨
    • 外侧/内侧髁
    • 后外侧/内侧髁
    • 髁间外侧/内侧结节
    • 结节
  • 远端轴中心
  • 髌骨
    • 近端(上级)/远端(下级)
    • 外侧/内侧缘
  • 腓骨
    • 头点

扫描要求

以下为测试该工具所用图像数据信息和分割运行时间(3 分 30 秒)参考。

脊柱 CT

分割部位

  • 骶骨
  • 椎骨:在图示中选择椎骨时是一个整体,但在分割后将按节段输出为单个的椎骨。

输出脊柱合并掩膜

如果勾选 Output additional spine joined mask 选项,将在分割结果中额外输出一个包含所有椎骨的合并掩膜。

扫描要求

以下为测试该工具所用图像数据信息和分割运行时间(3 分钟)参考。

翻修髋关节 CT

分割部位

  • 骶骨
  • 髋关节(右)
  • 髋关节(左)
  • 股骨(右)
  • 股骨(左)
  • 植入物:髋臼杯、股骨柄、其他金属和所有金属。

标志点标注

  • 股骨近端(右/左)
    • 小转子(右/左)
    • 大转子(右/左)
    • 股骨头中心(右/左)
  • 髋关节(右/左)
    • 耻骨结节(右/左)
    • 髂前上棘(右/左)
    • 髂后上棘(右/左)
  • 骶骨
    • 尾骨

扫描要求

以下为测试该工具所用图像数据信息和分割运行时间(5 分 30 秒)参考。

踝关节 CT

分割部位

  • 胫骨
  • 腓骨
  • 距骨
  • 跟骨

标志点标注

  • 踝关节中心
  • 外侧/内侧踝
  • 腓骨切迹

扫描要求

以下为测试该工具所用图像数据信息和分割运行时间(30 秒)参考。

膝关节 MRI

Knee MRI 工具可以由冠状位或矢状位高分辨率质子密度(PD) 加权 MRI 数据、冠状位高分辨率 T1 加权 MRI 数据或矢状位高分辨率 T2 加权 MRI 数据自动分割膝关节。

分割部位

  • 股骨
  • 股骨软骨
  • 胫骨
  • 胫骨软骨
  • 髌骨
  • 腓骨

MRI 图像加权

  • PD(冠状位和矢状位)
  • T1(冠状位)
  • T2(矢状位)

转换为平滑结构

MRI 数据通常具有较大的平面外间距,会导致在 3D 渲染模型中出现阶梯状。如果勾选 Convert to smooth geometry 选项,将会对该工具输出的原始结果进行一些额外的平滑处理。

因此,当需要平滑的 3D 输出(如面网格或体积网格的生成)时,建议勾选 Convert to smooth geometry。但当切片分割的精度至关重要(如测量和分析)时,不建议勾选该选项。

标志点标注

  • 股骨
    • 外侧/内侧髁
    • 外/内上髁
  • 胫骨
    • 外侧/内侧髁
    • 髁间隆起

扫描要求

以下为测试该工具所用图像数据信息和分割运行时间(2 分 50 秒)参考。

肩部 CT

分割部位

  • 肱骨
  • 肩胛骨
  • 锁骨

标志点标注

  • 肱骨
  • 骨头中心
    • 大/小结节
    • 二头肌沟
  • 肩胛骨
    • 肩峰
    • 喙突
    • 关节盂
    • 外侧/内侧缘
    • 上/下角
    • 脊柱
    • 切迹
  • 锁骨
    • 外侧/内侧端

扫描要求

以下为测试该工具所用图像数据信息和分割运行时间(2 分 35 秒)参考。

颅颌面 CT

分割部位

  • 颅骨
  • 颅骨(填充眼眶)
  • 下颌骨
  • 颈椎
  • 上/下尖牙
  • 上/下切牙
  • 上/下磨牙
  • 耳道
  • 气道
  • 眼球
  • 视神经
  • 下颌神经
  • 颅腔
  • 皮肤

标志点标注

  • 下颌骨
    • 下颌孔(左/右)
    • 下颌角(左/右)
    • 下颌联合
    • 冠突(左/右)
  • 髁突(左/右)
  • 颅骨
    • 眼眶(左/右)
    • 耳点(左/右)
    • 鼻根点
    • 枕骨大孔中心

分离牙齿

如果勾选 Split teeth 选项,该工具将尝试将牙齿分割为 6 个掩膜:上/下颌磨牙、尖牙和切牙。如果不勾选,牙齿将整体保持为一个掩膜。

扫描要求

以下为测试该工具所用图像数据信息和分割运行时间(8 分 53 秒)参考。

AS Cardio 心脏

AS Cardio:专为心脏 CTA 数据设计的自动分割工具,心脏瓣膜分析工具可对输出结构进行更详细地处理。

心脏 CT

分割部位

  • 主动脉
  • 左/右心室
  • 左/右心房
  • 心肌(左心室)
  • 肺动脉
  • 左/右冠状动脉

标志点标注

  • 主动脉
    • 瓣叶(右/左/后)
    • 联合(最多 3 个)
    • 冠状动脉口(右/左)
  • 左心室
    • 心尖和底部
  • 左心房
    • 附件
  • 右心室
    • 心尖
    • 三尖瓣质心
  • 右心房
    • 上/下腔静脉口质心
    • 冠状窦口质心
    • 附件

扫描要求

以下为测试该工具所用图像数据信息和分割运行时间(2 分 40 秒)参考。

心脏瓣膜分析

Heart valve analysis 工具可以通过处理心脏解剖分割和标志进行瓣膜分析,如瓣膜环生成和包含中心线生成的其他测量。

该工具的输入通常是 Heart CT 工具的输出结果,但也可以是用户创建的对象,如修改后的掩膜。在运行该工具之前,应检查掩膜的分割和标志点放置的准确性。

瓣膜选择

从心脏的 4 个瓣膜(主动脉瓣、二尖瓣、三尖瓣、肺动脉瓣)中选择一个进行分析,不同的选择具有相应的测量选项。

执行的分析

通过勾选复选框选择将要执行的各种分析类型。

  • Fit planes through cusps:此选项仅适用于主动脉瓣分析,通过主动脉瓣叶标志获得最佳拟合平面。
  • Measure distance to Ostia:此选项仅适用于主动脉瓣分析,将生成从主动脉口标志点到已拟合至主动脉瓣叶的平面的两个距离测量。
  • Fit plane through annulus:此选项通过环获得最佳拟合平面,输入掩膜用于确定三尖瓣或肺动脉瓣的平面。对于二尖瓣,从左心室心尖和底部标志创建一个垂直于左心室轴的平面。
  • Centreline analysis:此选项将对主动脉瓣或肺动脉瓣的输入进行详细的中心线分析。对于主动脉瓣,输出包括为升主动脉创建的一系列中心线,以及为窦管交界区、Valsalva 窦和管状升主动脉生成的最佳拟合圆。对于肺动脉瓣,输出包括为肺动脉干和左/右动脉创建的中心线。

生成的形状可用于设置 MPR 视图,从而对图像数据进行详细研究和进一步分析。

输入

将根据分析选项显示所需的输入。当项目文件中存在 Heart CT 工具的输出时,将预先填充 Landmarks 和 Masks 的列表。

  • Landmarks:从项目文件中现有的点测量列表中选择相应的标志。
  • Masks:选择与所选瓣膜相关的对应掩膜。

总结对话框

分析完成后将出现一个总结对话框,显示已生成所有新分析项的列表以及打开访问这些项所需相关工具的快捷链接。

当某个特定输出无法从输入测定时,将不会生成该输出结果。

参考

  • Simpleware 软件内置手册 Simpleware Auto Segmentation
sw/simpleware_自动分割.txt · 最后更改: 2024/11/04 22:11 由 liu.ning

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