atk:si_100_表面重构_用atk进行几何结构优化
差别
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| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版 | 上一修订版两侧同时换到之后的修订记录 | ||
| atk:si_100_表面重构_用atk进行几何结构优化 [2016/08/13 10:06] – [结果] dong.dong | atk:si_100_表面重构_用atk进行几何结构优化 [2016/08/13 10:07] – [结果] dong.dong | ||
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| - | 分析结构弛豫的轨迹也很有意义。选择LabFloor中，你之前保存的轨迹文件，点击Viewer大卡，可以看到优化的动画过程: | + | 分析结构弛豫的轨迹也很有意义。选择LabFloor中，你之前保存的轨迹文件，点击Viewer大卡，可以看到优化的动画过程（点开大图）: |
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| 如果我们对弛豫过程对每一步中的总能量和力作图，可以看到总能量或多或少是在持续下降的，这符合我们采用的BFGS能量最小化方法的期望。BFGS的初衷是为了能量的最小化，而不是仅仅跟随力的方向变化。下面的小脚本能够读取轨迹数据，并为每一步的总能量和力最大值作图： | 如果我们对弛豫过程对每一步中的总能量和力作图，可以看到总能量或多或少是在持续下降的，这符合我们采用的BFGS能量最小化方法的期望。BFGS的初衷是为了能量的最小化，而不是仅仅跟随力的方向变化。下面的小脚本能够读取轨迹数据，并为每一步的总能量和力最大值作图： | ||
atk/si_100_表面重构_用atk进行几何结构优化.txt · 最后更改: 2018/03/20 22:22 由 liu.jun