| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版上一修订版两侧同时换到之后的修订记录 |
| atk:创建分子-表面体系_苯分子在au_111_表面 [2018/05/11 17:01] – [苯吸附在Au(111)面] xie.congwei | atk:创建分子-表面体系_苯分子在au_111_表面 [2018/05/11 17:06] – [参考] xie.congwei |
|---|
| {{ :atk:snapped.png?direct&700 |}} | {{ :atk:snapped.png?direct&700 |}} |
| |
| 最后，参照文献 <color #ed1c24>[LRZ+13]</color> 调整分子-表面间的距离为 3.62 Å：在 **Move** 面板，如下图所示在锚点原子位置 $r_0$ 的 z 坐标处输入 18.0272 Å。 | 最后，参照文献 <color #ed1c24>[LRZ+13]</color> 调整分子-表面间的距离为 3.62 Å：在 **Move** 面板，如下图所示在锚点原子位置 |
| | $r_0$ 的 z 坐标处输入 18.0272 Å。 |
| |
| {{ :atk:zcoordinate.png?direct&700 |}} | {{ :atk:zcoordinate.png?direct&700 |}} |
| <WRAP center important 100%> | <WRAP center important 100%> |
| === 注意 === | === 注意 === |
| 一般情况下，为了设置所需的分子-表面距离，您一定要先知道金最顶层的笛卡尔坐标 Z。这可以通过把指针悬停在 Au(111)最顶层的一个原子上方而轻易获得。 | 一般情况下，为了设置所需的分子-表面距离，您一定要先知道金最顶层的笛卡尔坐标 Z。这可以通过把指针悬停在 Au(111) 最顶层的一个原子上方而轻易获得。 |
| </WRAP> | </WRAP> |
| |
| |
| |
| ===== 参考文献 ===== | ===== 参考 ===== |
| |
| * <color #ed1c24>[LRZ+13] </color> | (1, 2, 3, 4, 5, 6) Wei Liu, Victor G Ruiz, Guo-Xu Zhang, Biswajit Santra, Xinguo Ren, Matthias Scheffler, and Alexandre Tkatchenko. Structure and energetics of benzene adsorbed on transition-metal surfaces: density-functional theory with van der Waals interactions including collective substrate response. New Journal of Physics, 15(5):53046, 2013. [[http://stacks.iop.org/1367-2630/15/i=5/a=053046|URL: http://stacks.iop.org/1367-2630/15/i=5/a=053046]]. | * <color #ed1c24>[LRZ+13] </color> | (1, 2, 3, 4, 5, 6) Wei Liu, Victor G Ruiz, Guo-Xu Zhang, Biswajit Santra, Xinguo Ren, Matthias Scheffler, and Alexandre Tkatchenko. Structure and energetics of benzene adsorbed on transition-metal surfaces: density-functional theory with van der Waals interactions including collective substrate response. New Journal of Physics, 15(5):53046, 2013. [[http://stacks.iop.org/1367-2630/15/i=5/a=053046|URL: http://stacks.iop.org/1367-2630/15/i=5/a=053046]]. |
| | |
| | * 英文原文：[[https://docs.quantumwise.com/tutorials/benzene_au111/benzene_au111.html|https://docs.quantumwise.com/tutorials/benzene_au111/benzene_au111.html]] |
