VNL：界面

链接： K. Stokbro et al., PRB 85, 165442 (2012)

ATK可以轻松地处理如上面文章所涉及的含有两个不同电极的异构体系。在本教程，您将学习如何构建一个类似的体系。

• 步骤 1：点击 Add Add from Database，在数据库中搜索并选中镍，添加到 Stash。然后从晶体数据库中将石墨烯也添加到 Stash。

• 步骤 2：石墨烯和 Ni(111) 面匹配的很好，这也正是我们考虑的界面。采用切割工具 Builders Surface (Cleave) 沿晶体 (111) 面切成一个 3 层电极晶胞。

• 步骤 3：打开 Builders Interface 创建两体系间的界面。分别将 Ni(111) 构形和石墨烯拖至第一个和第二个插槽。
• 步骤 4：推荐选用可反映晶格对称性的最小晶胞。该晶胞为六角对称性，但对于本例的计算，使用矩形晶胞会更方便。因此，请单击 Select Surface Cells，然后选取原子数稍大但单元相同的晶胞，如下图所示。可点击左下角图中对应的点来选中该晶胞。
• 步骤 5：点击 Shift Surfaces，在 Z 的位置上增加至 2 Å。

• 步骤 6：用 Bulk Tools Repeat，沿 B 方向上扩胞至 12 倍以在扩展的 Ni(111) 界面上结合更大的石墨烯片。

• 步骤 7：打开 Selection Tools By Expression，输入 e = Ni and b > 0.5。按下 Enter 或Tab 键，以及 Delete 键。该操作将会切掉 Ni 平板的一半。

• 步骤 8：确定您想要的镍-石墨烯界面是多大，然后用鼠标选中、删除多余的碳原子。
• 步骤 9：如果您想使边缘碳原子的悬挂键饱和（请参阅文章 — 您可能想，也可能不想这样做），选中缘原子并使用钝化工具 。
• 步骤 10：由于输运方向始终是沿着 Z 方向，体系需要重新调整。采用 Bulk Tools Swap Axes，选择 B↔C 和 Y↔Z 切换轴的方向（通常您应该总是交换两次以获得一个右手体系）。
• 步骤 11：最后，使用 Device Tools Device From Buik 将结构转换为器件构形；默认选项就可以，所以只需点击 OK 即可。

• 英文原文：http://docs.quantumwise.com/tutorials/graphene_nickel.html