为了更顺利的建模，用户应当掌握以下操作方式：

• 旋转：按住鼠标右键拖动；
• 重置模型：Ctrl+R；这将使结构恢复到视图中央、并沿X轴显示；
• 缩放：用鼠标滚轮滚动；或用Ctrl+鼠标右键拖动；
• 平移：Shift+鼠标右键拖动。

• 选中单个原子：鼠标左键单击原子；
• 选中多个原子：鼠标左键拖动；（左侧第一个工具可以选择不同的拖动形状）
• 取消选定：单击空白处
• 分批选中不同的原子：先选中第一批，再按住Ctrl键选择第二批；
• 选中所有原子：Ctrl+A
• 选中所有连键的原子：鼠标左键双击某个原子可以选中所有连在一起的原子；
• 选中所有相同元素的原子：按住Shift键，鼠标左键双击某个原子。