atk:使用vnl-gui构建结构模型
使用VNL-GUI构建结构模型
建模工具
VNL Builder 是VNL的全功能建模工具，内含结构数据库、结构操作工具、转换工具，以及多种的模板建模工具。
QuantumATK支持的结构模型
在Builder中可以创建Bulk、Device、Molecule和NEB四种结构模型，他们分别支持：
| 模型名称 | 支持的体系 | 边界条件 | 支持的计算工具 |
|---|---|---|---|
| Bulk | 晶体结构素单胞、结晶学单胞、超胞、表面Slab、界面Slab等周期结构体系 | 周期边界条件 | 可用于QuantumATK、VASP等进行计算 |
| Device | 基于开放边界条件的双电极器件体系，模拟器件和材料的界面 | 开放边界条件 | 仅用于QuantumATK计算 |
| Molecule | 非周期的孤立体系 | 狄利克雷边界条件 | 仅用于QuantumATK计算 |
| Surface | 单边半无限表面模型 （QuantumATK独有模型） | 开放边界条件+Neumann边界条件 | 仅用于QuantumATK计算 |
| NEB | 用于NEB计算的初始路径，含有从初始结构到最终结构的一系列结构 | – | 可用于QuantumATK、VASP等进行计算 |
通常计算模拟的基本模型是Bulk模型，这里的Bulk是广义的三维周期结构模型（相对于Device和Molecule模型而言），这包括所有带有三维周期边界条件的体系，例如带有真空填充层的表面Slab模型。
其中Bulk、Device、和Molecule三种模型可以在一定条件下相互转换。
构建块体材料结构模型
新建块体材料结构模型主要有以下几种方法：
- 手头有其他结构文件如CIF、POSCAR等，可以直接导入Builder；
- 在内置的数据库中直接搜索得到需要的结构；
- 石墨烯一类的NanoSheet、NanoRibbon等结构可以从内置的模板新建；
- 手头有结晶学数据，可以从Crystal Builder创建晶体结构。
导入其他结构文件
VNL Builder支持导入几乎可以导入所有常见类型的结构文件。例如：包括：XYZ（*.xyz）、CAR（*.car）、CASTEP（*.cell、*.geom）、CIF（*.cif）、FHI-aims（*.in）、Quantum Espresso（*.in）、ASE（*.py）、VASP（POSCAR、CONTCAR）等。
在线检索结构数据库
VNL Builder 还支持直接在线查询Crystallography Open Database (COD)中的几十万种晶体结构数据，详见：VNL的结构数据库功能。
atk/使用vnl-gui构建结构模型.txt · 最后更改: 2018/03/20 18:31 由 liu.jun