这是本文档旧的修订版!
我们以简单分子动力学模拟为例,单纯演示如何生成沿着A、B、C晶轴方向的温度分布情况。
方法:在*.run文件中,通过Trajectory字段设置TProfileGridPoints实现,例如:
TProfileGridPoints 40
保存作业后,修改*.run文件(记事本可以打开)如下,在Trajectory字段内增加了“TProfileGridPoints 40”的设置。如果没Trajectory字段,用户可以自行添加:
......省略 MolecularDynamics NSteps 10000 Trajectory SamplingFreq 1000 TProfileGridPoints 40 End InitialVelocities Temperature 498 End Thermostat Type NHC Temperature 498 Tau 5 End End System Atoms ......省略
SamplingFreq 1000是我们在图