Python脚本右键另存下载 该脚本只能分析AMS2023版的ReaxFF输出轨迹文件*.results/ams.rkf。

运行方式：

• AMSjobs → Help → Command-line → 打开命令行窗口输入sh回车（如果是Linux，本身就有命令行，直接打开命令行即可）
• 该脚本下载到某个文件夹，例如D:/ADA_DATA/MoleculesTable.py，确定作业的*.resutls/ams.rkf文件的路径，例如D:\ADF_DATA\Task\test.results\ams.rkf
• 在命令行输入：amspython D:/ADA_DATA/MoleculesTable.py D:/ADF_DATA/Task/test.results/ams.rkf回车。稍后将产生分子数列表窗口，可以关闭：

• 然后会弹出化学键数窗口，也可以关闭：

• 将生成：molecule_analysis.txt、molecule_analysis.pdf、bond_analysis.txt、bond_analysis.pdf四个文件。其中*.pdf文件是图，*.txt文件是曲线对应的数据，其中第一列为“帧”数，其他列为具体数据。

该脚本默认统计单、双、三键，如果需要统计芳香键，则修改脚本中：

    round_type = 'integer'       # round bond orders to nearest integer
    #round_type = 'half_integer' # round bond orders to nearest half integer

为

    #round_type = 'integer'       # round bond orders to nearest integer
    round_type = 'half_integer' # round bond orders to nearest half integer