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adf:pesexploration

AMS软件:自动探索表面吸附位点

  • 版本:本功能适用版本为AMS2022。
  • 模块:这里以ReaxFF模块为例,其他模块的使用,除Main窗口参数设置不同之外,其他一致,因此可以用于DFTB、MOPAC、BAND、机器学习势。
  • 模型:二维周期性体系表面吸附小分子或原子团簇,本例仅以O原子为例。

参数设置

将体系分为两个region,Slab与吸附区域(下图所示region名为active):

设置探索参数,探索次数和探索“人数”,每个人次数越多、人数越多,则计算量时间越长,也越全面,当然这跟体系表面的大小也有直接关系,例如此次可以改为40/8

告诉软件哪个是表面,并将-1.0埃改为1.0埃,从而让软件能够较好的识别等价结构

探索时移动的小分子或原子簇,此处为active这个region,适当提高max energy例如到30eV,能大幅度增大搜索范围

建议在脚本中增加一行:RandomSeed 10,这是作者建议的一个随机种子,能够更好的探索:

计算过程,或者计算完毕,在SCM → Movie中可以看到探索的各种吸附位点,并在右侧显示每个编号的位点的能量。能量最低的,一般拍在第一帧,后面的帧能量依次增大。有一些报错信息可以忽略(这是搜索过程中某些搜索行为失败而生成的),只要Movie中有相应结果即可。

任意一帧结构均可File → save geometry或Update Geometry in Input,保存为xyz格式文件或更新到AMSinput窗口。

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adf/pesexploration.txt · 最后更改: 2024/06/14 07:50 由 liu.jun

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