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adf:openshellfragmentanalysis

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adf:openshellfragmentanalysis [2017/05/21 09:54] – [如何进行开壳层片段的分析] liu.junadf:openshellfragmentanalysis [2019/12/07 01:41] – liu.jun
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 ======如何进行开壳层片段的分析====== ======如何进行开壳层片段的分析======
 +本功能要求AMS2019.301以上版本。
  
 一般的、普通的闭壳层片段（构造成闭壳层分子）的片段分析，参考费米维基：[[adf:hbondanalysis|]]。新版ADF的计算中，<color blue>片段</color>的计算必须使用Restricted方法，但<color blue>整个体系</color>的计算可以使用Unrestricted。 一般的、普通的闭壳层片段（构造成闭壳层分子）的片段分析，参考费米维基：[[adf:hbondanalysis|]]。新版ADF的计算中，<color blue>片段</color>的计算必须使用Restricted方法，但<color blue>整个体系</color>的计算可以使用Unrestricted。
  
 <color blue> <color blue>
-该方法缺点：使用Restricted方法计算，这本身带来了比较大的误差；另外，开壳层片段的时候，如果分别指定alpha、beta电子，往往很难收敛到正确的占据方式上；如果使用类似A 14 1 1的指定方式，电子却又是均匀分布在alpha、beta上的（这也会带来一定误差，但文献中一般也采用了后面这种方式），而通过Fragmentoccupations再指定一遍A 7 / / 9，程序内部实际上用之前A 7 0.5 0.5/ / 7 0.5 0.5的占据，做了1次迭代，然后直接将电子按照A 7 / / 9的方式占据，然后进行片段分析的整体计算——这是用的最多的一种方式。具体指定电子占据的方式，参考：[[adf:如何为对称性的分子指定电子的占据方式]]。还有一种方法，也被少数人采用，也就是用Unrestricted方法来计算，完成之后，修改*.t21文件，删掉其中一种自旋，修改占据数，伪装成Restricted占据，这带来的误差实际上也相当大。</color>+该方法缺点：使用Restricted方法计算，这本身带来了比较大的误差；另外，开壳层片段的时候，尤其是对于高自旋态（三重态及其以上），如果分别指定alpha、beta电子，往往很难收敛到正确的占据方式上；如果使用类似A 14 1 1的指定方式，电子却又是均匀分布在alpha、beta上的（这也会带来一定误差，但文献中一般也采用了后面这种方式），而通过Fragmentoccupations再指定一遍A 7 / / 9，程序内部实际上用之前A 7 0.5 0.5/ / 7 0.5 0.5的占据，做了1次迭代，然后直接将电子按照A 7 / / 9的方式占据，然后进行片段分析的整体计算——这是用的最多的一种方式。具体指定电子占据的方式，参考：[[adf:如何为对称性的分子指定电子的占据方式]]。还有一种方法，也被少数人采用，也就是用Unrestricted方法来计算，完成之后，修改*.t21文件，删掉其中一种自旋，修改占据数，伪装成Restricted占据，这带来的误差实际上也相当大。</color>
  
 <color blue>真正精确、严格的开壳层片段分析、ETS-NOCV计算，需要使用BAND模块（使用Unrestricted方法来精确计算片段，然后用Unrestricted片段来计算整个分子体系），可以得到精确的EDA信息、NOCV信息，但缺点是：目前的版本尚不能定量列出碎片轨道对NOCV轨道的贡献大小，只能在View中定性地看到。参考：[[adf:accurateeda-nocvforopenshell]] <color blue>真正精确、严格的开壳层片段分析、ETS-NOCV计算，需要使用BAND模块（使用Unrestricted方法来精确计算片段，然后用Unrestricted片段来计算整个分子体系），可以得到精确的EDA信息、NOCV信息，但缺点是：目前的版本尚不能定量列出碎片轨道对NOCV轨道的贡献大小，只能在View中定性地看到。参考：[[adf:accurateeda-nocvforopenshell]]
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 {{ :adf:openshellfragment03.png?600 |}} {{ :adf:openshellfragment03.png?600 |}}
  
-可以点击上图红框内所示的三个圆点，打开三个片段的计算参数设置的ADFinput窗口，可以对每个片段的电子占据方式进行指定：+可以点击上图红框内所示的三个圆点，打开三个片段的计算参数设置的ADFinput窗口，可以对每个片段的电荷、电子占据方式进行指定：
  
 在片段的ADFinput > Model > Spin and Occupations进行指定，例如ADFinput > Details > Userinput手写输入。具体参考费米维基：[[adf:如何为对称性的分子指定电子的占据方式]]）。这里我们对开壳层片段的Restricted计算，都采用默认的占据方式（片段中的电子具体是如何占据的，可以去看每个片段计算的out文件或者点ADF LOGO > Level查看）。 在片段的ADFinput > Model > Spin and Occupations进行指定，例如ADFinput > Details > Userinput手写输入。具体参考费米维基：[[adf:如何为对称性的分子指定电子的占据方式]]）。这里我们对开壳层片段的Restricted计算，都采用默认的占据方式（片段中的电子具体是如何占据的，可以去看每个片段计算的out文件或者点ADF LOGO > Level查看）。

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