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adf:nocv-disdinguishbonding

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adf:nocv-disdinguishbonding [2019/12/07 12:50] liu.junadf:nocv-disdinguishbonding [2020/11/22 10:56] – [ETS-NOCV功能案例:二聚体能量分解(EDA)中轨道作用、电子在片段轨道间转移的分解] liu.jun
行 1: 行 1:
-======ETS-NOCV功能案例:二聚体能量分解(EDA)中轨道作用、电子在片段轨道间转移的分解======+======ETS-NOCV功能案例(闭壳层体系):二聚体能量分解(EDA)中轨道作用、电子在片段轨道间转移的分解======
 =====理论参考===== =====理论参考=====
  
行 143: 行 143:
 =====注意一:===== =====注意一:=====
 从上面可以看到: 从上面可以看到:
-  - 这种分法并不是严格的,比如第一组里面实际上包含了少量其他无关成分,第二组也包含了少量的无关成分,但定性的大小关系上可以给我们明确而有力的参考。+  - 这种分法和两个氢键分配并不是严格对应的,比如第一组里面实际上包含了少量其他无关成分,第二组也包含了少量的无关成分,但定性的大小关系上可以给我们明确而有力的参考。
   - 还有其他对轨道作用贡献较小的NOCV,我们可以自己去看看,会发现剩下的NOCV主要是分子内部的极化,也就是分子内部电子的转移。具体可以从NOCV def Density查看成键前后,电子的从什么轨道上转移到什么轨道上。   - 还有其他对轨道作用贡献较小的NOCV,我们可以自己去看看,会发现剩下的NOCV主要是分子内部的极化,也就是分子内部电子的转移。具体可以从NOCV def Density查看成键前后,电子的从什么轨道上转移到什么轨道上。
-  - NOCV def Densities,是“正本征值NOCV orbital的模方” - “负本征值NOCV orbital的模方”,不过在理解上要注意,负本征值NOCV Orbital实际上一部分是占据电子的,另一部分是不占据电子的。正本征值NOCV Orbital则是形成化学键,整个轨道上都占了电子的。当然程序自动求得NOCV def Density,已经考虑到了这一点。因此表示电子的流向,负值表示失去电子,正值表示得到电子,与“SFO contribution”列表中的贡献值(也就是具体每个SFO得失电子的个数)对应。真正能够可靠地、直观地、明确无误地表征成键作用的,是NOCV def Density。这是一个描述成键导致电子转移的分布图。所以文献中,一般并不讨论NOCV Orbital,而只讨论NOCV def Density。+  - NOCV def Densities,是“正本征值NOCV orbital的模方” - “负本征值NOCV orbital的模方”,不过在理解上要注意,负本征值NOCV Orbital实际上一部分是占据电子的,另一部分是不占据电子的。正本征值NOCV Orbital则是形成化学键,整个轨道上都占了电子的。当然程序自动求得NOCV def Density,已经考虑到了这一点。因此NOCV def Densities表示电子的流向,负值表示失去电子,正值表示得到电子,与“SFO contribution”列表中的贡献值(也就是具体每个SFO得失电子的个数)对应。真正能够可靠地、直观地、明确无误地表征成键作用的,是NOCV def Density。这是一个描述成键导致电子转移的分布图。所以文献中,一般并不讨论NOCV Orbital,而只讨论NOCV def Density。
 =====注意二:===== =====注意二:=====
 出现“Not all NOCV orbitals pair! The results might be useless”这样的提示,或者NOCV轨道正负本征值没有配对,则表示NOCV方法对这个体系分析失败了,结果无效。 出现“Not all NOCV orbitals pair! The results might be useless”这样的提示,或者NOCV轨道正负本征值没有配对,则表示NOCV方法对这个体系分析失败了,结果无效。
 =====注意三:===== =====注意三:=====
 AMS2018以后,在SCM LOGO > View中,可以显示SFO的空间分布情况。因此,结合该组NOCV的“SFO contribution”列表中负“contribution”的情况,可以具体看到电子从哪个SFO流到哪个SFO去了。失去电子的SFO为Donor orbital,得到电子的为Acceptor orbital。 AMS2018以后,在SCM LOGO > View中,可以显示SFO的空间分布情况。因此,结合该组NOCV的“SFO contribution”列表中负“contribution”的情况,可以具体看到电子从哪个SFO流到哪个SFO去了。失去电子的SFO为Donor orbital,得到电子的为Acceptor orbital。

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