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adf:nocv-disdinguishbonding [2019/12/07 12:47] – liu.jun | adf:nocv-disdinguishbonding [2020/11/22 10:56] – [ETS-NOCV功能案例:二聚体能量分解(EDA)中轨道作用、电子在片段轨道间转移的分解] liu.jun | ||
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- | ======ETS-NOCV功能案例:二聚体能量分解(EDA)中轨道作用、电子在片段轨道间转移的分解====== | + | ======ETS-NOCV功能案例(闭壳层体系):二聚体能量分解(EDA)中轨道作用、电子在片段轨道间转移的分解====== |
=====理论参考===== | =====理论参考===== | ||
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===成键后的样子=== | ===成键后的样子=== | ||
- | {{ : | + | 选择NOCV Orbital 0.16882:就是左边碎片分子的占据轨道和右边碎片分子的空轨道形成的氢键的样子: |
- | + | ||
- | 选择NOCV Orbital | + | |
{{ : | {{ : | ||
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=====注意一:===== | =====注意一:===== | ||
从上面可以看到: | 从上面可以看到: | ||
- | - 这种分法并不是严格的,比如第一组里面实际上包含了少量其他无关成分,第二组也包含了少量的无关成分,但定性的大小关系上可以给我们明确而有力的参考。 | + | - 这种分法和两个氢键分配并不是严格对应的,比如第一组里面实际上包含了少量其他无关成分,第二组也包含了少量的无关成分,但定性的大小关系上可以给我们明确而有力的参考。 |
- 还有其他对轨道作用贡献较小的NOCV,我们可以自己去看看,会发现剩下的NOCV主要是分子内部的极化,也就是分子内部电子的转移。具体可以从NOCV def Density查看成键前后,电子的从什么轨道上转移到什么轨道上。 | - 还有其他对轨道作用贡献较小的NOCV,我们可以自己去看看,会发现剩下的NOCV主要是分子内部的极化,也就是分子内部电子的转移。具体可以从NOCV def Density查看成键前后,电子的从什么轨道上转移到什么轨道上。 | ||
- | - NOCV def Densities,是“负本征值NOCV orbital的模方” - “正本征值NOCV orbital的模方”,不过在理解上要注意,负本征值NOCV Orbital实际上一部分是占据电子的,另一部分是不占据电子的。正本征值NOCV Orbital则是形成化学键,整个轨道上都占了电子的。当然程序自动求得NOCV def Density,已经考虑到了这一点。因此表示电子的流向,负值表示失去电子,正值表示得到电子,与“SFO contribution”列表中的贡献值(也就是具体每个SFO得失电子的个数)对应。真正能够可靠地、直观地、明确无误地表征成键作用的,是NOCV def Density。这是一个描述成键导致电子转移的分布图。所以文献中,一般并不讨论NOCV Orbital,而只讨论NOCV def Density。 | + | - NOCV def Densities,是“正本征值NOCV orbital的模方” - “负本征值NOCV orbital的模方”,不过在理解上要注意,负本征值NOCV Orbital实际上一部分是占据电子的,另一部分是不占据电子的。正本征值NOCV Orbital则是形成化学键,整个轨道上都占了电子的。当然程序自动求得NOCV def Density,已经考虑到了这一点。因此NOCV def Densities表示电子的流向,负值表示失去电子,正值表示得到电子,与“SFO contribution”列表中的贡献值(也就是具体每个SFO得失电子的个数)对应。真正能够可靠地、直观地、明确无误地表征成键作用的,是NOCV def Density。这是一个描述成键导致电子转移的分布图。所以文献中,一般并不讨论NOCV Orbital,而只讨论NOCV def Density。 |
=====注意二:===== | =====注意二:===== | ||
出现“Not all NOCV orbitals pair! The results might be useless”这样的提示,或者NOCV轨道正负本征值没有配对,则表示NOCV方法对这个体系分析失败了,结果无效。 | 出现“Not all NOCV orbitals pair! The results might be useless”这样的提示,或者NOCV轨道正负本征值没有配对,则表示NOCV方法对这个体系分析失败了,结果无效。 | ||
=====注意三:===== | =====注意三:===== | ||
AMS2018以后,在SCM LOGO > View中,可以显示SFO的空间分布情况。因此,结合该组NOCV的“SFO contribution”列表中负“contribution”的情况,可以具体看到电子从哪个SFO流到哪个SFO去了。失去电子的SFO为Donor orbital,得到电子的为Acceptor orbital。 | AMS2018以后,在SCM LOGO > View中,可以显示SFO的空间分布情况。因此,结合该组NOCV的“SFO contribution”列表中负“contribution”的情况,可以具体看到电子从哪个SFO流到哪个SFO去了。失去电子的SFO为Donor orbital,得到电子的为Acceptor orbital。 |