差别

这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。

--- adf:nics [2017/03/06 18:21] – liu.jun
+++ adf:nics [2020/11/18 23:46] – [保存该文件后，运行该文件] liu.jun
@@ 行 1: / 行 1: @@
 ====== 如何计算Nucleus Independent Chemical Shifts======
-，将[[adf:如何优化分子的几何结构|优化]]好的结构导入ADFinput，并依次设置参数如下图所示：
+=====参数设置 =====
+将[[adf:geoopt2019|优化]]好的结构导入ADFinput，并依次设置参数如下图所示：
-{{adf:nics01.jpg|}}
+{{ adf:nics01.jpg?650 }}
-基组、泛函、冻芯可以根据精度的需要，进行相应的调整，详见[[adf:geoopt]]、[[adf:homolumo|单点计算]]
 在希望计算NICS的位置上，添加Ghost原子，也即元素周期表中右下角的Xx原子
-{{adf:nics09.jpg|}}
+{{ adf:nics02.jpg?650 }}
 在Properties—NMR菜单中将Ghost原子Xx选中，点击下图所示的“+”：
-{{adf:nics10.jpg|}}
+{{ adf:nics04.jpg?650 }}
-保存TAPE10文件：
-{{adf:nics03.jpg|}}
 取消对称性：
-{{adf:nics04.jpg|}}
+{{ adf:nics03.jpg?650 }}
-保存*.run文件
+=====保存该文件后，运行该文件=====
+参考：[[adf:maintance]]
-{{adf:nics05.jpg|}}
-，保存该文件后，运行该文件：
-）在Linux下：
-  * 普通列表项目adfjobs—选中该任务—job—run
-  * ADFinput—File—Run
-  * 在run文件所在目录直接执行./*run >*.out
-）在Windows下：
-  * adfjobs—选中该任务—job—run
-  * ADFinput—File—Run
-  * 在run文件所在目录直接双击run文件执行，或右键点击run文件，然后选择“运行方式”中带adf图标的方式，运行
 ，结果查看：
-在生成的logfile文件末尾我们可以看到我们需要计算的两个点的化学位移屏蔽张量：
+在生成的logfile文件末尾我们可以看到我们需要计算的这个点的NMR屏蔽量(即Gh(1))：
-{{adf:nics07.jpg|}}
-在out文件的末尾也可以看到类似更详细的内容：
-{{adf:nics08.jpg|}}
+<code>
+<Dec06-2019> <23:40:07>  NMR Shielding ADF-GUI atom   P(1):         162.70 ppm
+<Dec06-2019> <23:40:07>  >>>> ZSGP
+<Dec06-2019> <23:40:07>  >>>> ZSGD
+<Dec06-2019> <23:40:08>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(2):         175.97 ppm
+<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGP
+<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGD
+<Dec06-2019> <23:40:08>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(3):         175.99 ppm
+<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGP
+<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGD
+<Dec06-2019> <23:40:09>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(4):         175.97 ppm
+<Dec06-2019> <23:40:09>  >>>> ZSGP
+<Dec06-2019> <23:40:09>  >>>> ZSGD
+<Dec06-2019> <23:40:09>  NMR Shielding  Gh(1):           0.84 ppm
+</code>
-，NICS：
+在out文件的末尾也可以看到类似更详细的内容，包括顺磁、逆磁、总和：
-Ghost可以被看作是一个中子，因此该点的NICS的值为该点的屏蔽张量中的各向同性部分乘以-1——也就是logfile中，该点的NMR Shielding值乘以-1。
+<code>
+****  G H O S T : Gh(1)
+                 COORDINATES (ANGSTROMS)
+                 -------------------------------------
+.5271     -0.3214     -0.0960
+ Internal NMR numbering of atoms: Gh(5)
+===  PARAMAGNETIC ISOTROPIC NMR SHIELDINGS (ppm)
+                     paramagnetic b^(1) =      0.000
+                     paramagnetic u^(1) =    -29.814
+                     paramagnetic s^(1) =     20.010
+                     paramagnetic gauge =      8.049
+          ------------------------------------------
+                     total paramagnetic =     -1.756
+          ------------------------------------------
+===  DIAMAGNETIC ISOTROPIC NMR SHIELDINGS (ppm)
+                       diamagnetic core =      0.000
+                    diamagnetic valence =      2.596
+          ------------------------------------------
+                      total diamagnetic =      2.596
+          ------------------------------------------
+===  TOTAL ISOTROPIC NMR SHIELDING (ppm)
+          ------------------------------------------
+              total isotropic shielding =      0.840
+          ------------------------------------------
+</code>
-终。
+=====NICS=====
+Ghost可以被看作是一个中子，因此该点的NICS的值为该点的屏蔽张量中的各向同性值(也就是logfile中该点的NMR Shielding值)乘以-1。
-ADF软件提供**免费试用**（一般为一个月），试用申请方式参见**费米科技维基百科：[[adf:trial|]]**
+AMS提供**免费试用**（一般为一个月），试用申请方式参考：[[adf:trial|]]**

费米维基

用户工具

站点工具

差别

页面工具