差别

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--- adf:isotop [2017/03/05 18:13] – liu.jun
+++ adf:isotop [2020/11/13 20:57] – liu.jun
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 ====== 如何计算同位素引起的红外谱的位移 ======
-简单起见，我们以水分子为例，展示ADF如何计算同位素引起的红外谱的位移（这是ADF最新版ADF2014.07的功能）。步骤如下：
+简单起见，我们以水分子为例，展示ADF如何计算同位素引起的红外谱的位移（ADF2014.07以后的版本具有此功能），本教程使用AMS2019.301制作。
-第一步：[[adf:如何优化分子的几何结构|优化分子的几何结构]]：
-{{:adf:freq-iso01.jpg|}}
+步骤如下：
-结构优化更详细的参数选择，参考费米维基：“[[adf:如何优化分子的几何结构|如何优化分子的几何结构]]”
+第一步：[[adf:geoopt2019]]：
+{{ :adf:isotopinadf01.jpg?650 }}
+结构优化更详细的参数选择，参考费米维基：“[[adf:geoopt]]”
 第二步：基于第一步优化得到的几何结构，计算红外谱：
-{{:adf:freq-iso02.jpg|}}
+{{ :adf:isotopinadf02.jpg?650 }}
-更详细的参数设置参考费米维基：“[[adf:如何计算分子的频率_红外吸收谱|如何计算分子的频率、红外吸收谱]]”。
+更详细的参数设置参考费米维基：“[[adf:ir]]”。
 计算同位素引起的位移需要添加的额外设置：
-{{:adf:freq-iso03.jpg|}}
+{{ :adf:isotopinadf03.jpg?650 }}
 语句IsotopicShift 2=2 3=2的含义：
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 第2,3个原子的相对质量为2，在本例中，第2,3个原子也就是H原子：
-{{:adf:freq-iso04.jpg|}}
+{{ :adf:isotopinadf04.jpg?650 }}
 如此也就是设置了水分子中的H为氘。
-第三步：File-Save as保存任务（注意保存任务要避免文件夹、路径、文件名带有中文字符或者空格），并运行File-Run（投递任务的其他方式参考费米维基：“[[[[adf:parallel|ADF如何提交并行计算任务]]”）
+第三步：File-Save as保存任务（注意保存任务要避免文件夹、路径、文件名带有中文字符或者空格），并运行File-Run（投递任务的其他方式参考费米维基：“[[adf:maintance|ADF如何提交并行计算任务]]”）
 第四步，查看结果：
-{{:adf:freq-iso05.jpg|}}
+{{ :adf:isotopinadf05.jpg?650 }}
-如此则打开文本格式的输出文件，在out文件的窗口下方输入Isotopic（不区分大小写），搜到输出文件中关于同位素引起红外谱位移的部分，如下：
+如此则打开文本格式的输出文件，在out文件的窗口下方输入Iso（不区分大小写），搜到输出文件中关于同位素引起红外谱位移的部分，如下：
-{{:adf:freq-iso06.jpg|}}
+{{ :adf:isotopinadf06.jpg?650 }}
-注意：对于原子数大于2的分子，前面6个频率是关于平动的，和振动无关，实际有意义的，是第7个频率及其之后的频率。因此水分子中氘（此例中两个H原子都为氘）引起的红外谱的偏移如上图红色方框内所示，分别为-425.31 cm<sup>-1</sup>、-1003.36cm<sup>-1</sup>、-987.98cm<sup>-1</sup>，也即水分子中H全部替换为氘之后，红外振动的波数分别少425.31、1003.36、987.98。
+注意：对于原子数大于2的分子，前面6个频率是关于平动的，和振动无关，实际有意义的，是第7个频率及其之后的频率。因此水分子中氘（此例中两个H原子都为氘）引起的红外谱的偏移如上图红色方框内所示，分别为-380.83 cm<sup>-1</sup>、-1072.66 cm<sup>-1</sup>、-1059.57 cm<sup>-1</sup>，也即水分子中H全部替换为氘之后，红外振动的波数分别少425.31、1003.36、987.98。
 查看没有同位素引起位移的原始的红外谱：
-{{:adf:freq-iso07.jpg|}}
+{{ :adf:isotopinadf07.jpg?650 }}
-{{:adf:freq-iso08.jpg|}}
+{{ :adf:isotopinadf08.jpg?650 }}
-{{:adf:freq-iso09.jpg|}}
 注意该图谱中没有显示前面6个关于平动的频率，平动的频率只是一个纯数学的数字，在实验上不会观察到，因此不必去理会。
-其中的符号A1、B2是点群中不可约表示的符号，是关于对称性的一些标记，其意义可以参看参考费米维基：“[[adf:文献重现_锌酞菁的基态与激发态计算_第一部分]]”、“[[adf:文献重现_锌酞菁的基态与激发态计算_第二部分]]”
+AMS软件提供**免费试用**（一般为一个月），试用申请方式参见**：[[adf:trial|]]**
-ADF软件提供免费试用（一般为一个月），试用申请方式参见**费米维基：[[adf:trial|]]**

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