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adf:homolumo

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adf:homolumo [2019/12/07 09:36] – [3,运行计算] liu.junadf:homolumo [2020/11/12 14:12] (当前版本) – 移除 liu.jun
行 1: 行 1:
-====== 单点计算、计算HOMO、LUMO、离子势IP、亲和能EA====== 
-=====1,建模===== 
  
-导入优化好的分子(此处假定分子已经是优化好的结构,如果结构没有优化好,那么可以参考[[adf:geoopt]]) 
- 
-打开ADFjobs窗口,SCM - New Input打开新的Input窗口(Linux系统如果有桌面,那么在命令行输入ADFinput即打开Input窗口),File - Import Coordinates 可以读取xyz、mol等格式的坐标。 
- 
-=====2,参数设置===== 
- 
-{{ adf:homo-lumo03.jpg?650 }} 
- 
-补充说明: 
-  * 详细参数说明,例如泛函、基组、相对论、自旋极化、电荷的选择,参考:[[adf:parameters]] 
-  * 杂化泛函例如B3LYP计算HOMO、LUMO的值一般比GGA精确,但是注意B3LYP不适用于强关联体系、多金属中心体系; 
-=====3,运行计算===== 
- 
-{{ adf:homo-lumo04.jpg?650 }} 
- 
-提交作业,可以如上图所示,在Input窗口,File - Run提交,也可以在ADFjobs窗口,点击该行(该行变成灰色)选中该任务,然后菜单栏Job - Run提交。ADFjobs窗口,右边的齿轮表示正在运行 
- 
-{{ adf:homo-lumo05.jpg?500 }} 
- 
-如果要杀死任务,可以选中该任务,然后Job - Kill。运行完毕后,右侧的标志从齿轮变成了实心球: 
- 
-{{ adf:homo-lumo06.jpg?500 }} 
- 
-=====4,查看Bonding Energy===== 
-在*.logfile尾部有Bonding Energy信息: 
-<code> 
- 
-</code> 
- 
-=====4,查看HOMO、LUMO===== 
- 
-可以在Input窗口,SCM - levels,或者在ADFjobs窗口,选中该任务,SCM - levels,从而打开该任务的结果的能级图: 
- 
-{{ adf:homo-lumo07.jpg?650 }} 
- 
-第二列的能级是分子的能级,第一列,以及后面所有列,都是原子的能级,这个图反应分子轨道与原子轨道的关系。其中红色或者蓝色的线,表示分子轨道与原子轨道的对应关系,线越粗,表示该原子轨道对分子轨道的贡献越大。 
- 
-{{ adf:homo-lumo08.jpg?650 }} 
- 
-鼠标停留在分子轨道的时候,可以定量的显示贡献的百分比。蓝线表示形成杂化形成分子轨道、共价键。 
- 
-{{ adf:homo-lumo09.jpg?600 }} 
- 
-注意,这个能量单位是Hatree,1Hartree=27.2113845eV 
- 
-查看轨道空间分布:右键点击感兴趣的能级,选取轨道的序号, 
- 
-{{ adf:homo-lumo13.jpg?600 }} 
- 
-弹出View窗口,显示轨道的空间分布: 
- 
-{{ adf:homo-lumo14.jpg?400 }} 
- 
-下拉窗口的下边界,显示出轨道显示的详细设置,选择Show details: 
- 
-{{ adf:homo-lumo15.jpg?400 }} 
- 
-将默认的100改为40,这是关于透明度的设置,100表示不透明,数值越小越透明: 
- 
-{{ adf:homo-lumo18.jpg?400 }} 
- 
-如果要看所有能量的情况,可以打开out文件查看文本内容:ADFjobs窗口选中该任务,或者level、Input、View、窗口均可(各个窗口实际上是自动根据任务而关联起来的),SCM - Output - Properties - Orbital Energies all Irreps,显示所有分子的所有能级: 
- 
-<code> 
- HOMO :        1 PI.g             -0.38340490585301E+00 
- LUMO :        2 PI.u              0.16788680856711E-01 
-   
- 
- 
- Orbital Energies, all Irreps 
- ======================================== 
- 
- Irrep        no.  (spin)   Occup              E (au)                E (eV) 
- --------------------------------------------------------------------------- 
- SIGMA.u                   2.00       -0.19221456734864E+02      -523.0425 
- SIGMA.g                   2.00       -0.19221448557672E+02      -523.0422 
- SIGMA.g                   2.00       -0.10379882248430E+02      -282.4510 
- SIGMA.g                   2.00       -0.11724261880376E+01       -31.9033 
- SIGMA.u                   2.00       -0.11320813233100E+01       -30.8055 
- SIGMA.g                   2.00       -0.57527460452052E+00       -15.6540 
- SIGMA.u                   2.00       -0.53171931259886E+00       -14.4688 
- PI.u          1             4.00       -0.52463941496627E+00       -14.2762 
- PI.g          1             4.00       -0.38340490585301E+00       -10.4330 
- PI.u          2             0.00        0.16788680856711E-01         0.4568 
- SIGMA.g                   0.00        0.54073688941536E-01         1.4714 
- SIGMA.u                   0.00        0.14912391239612E+00         4.0579 
- PI.u          3             0.00        0.14919287448829E+00         4.0597 
- SIGMA.g                   0.00        0.34179613930961E+00         9.3007 
- PI.g          2             0.00        0.45433200122225E+00        12.3630 
- SIGMA.g                   0.00        0.46643364198318E+00        12.6923 
- SIGMA.u                   0.00        0.48698831822596E+00        13.2516 
- PI.u          4             0.00        0.66294420044741E+00        18.0396 
- DELTA.g                   0.00        0.87338992915388E+00        23.7661 
- SIGMA.u                   0.00        0.91361491437553E+00        24.8607 
- PI.g          3             0.00        0.11056269392172E+01        30.0856 
- DELTA.u                   0.00        0.11372440649121E+01        30.9460 
- SIGMA.u                   0.00        0.14591842260476E+01        39.7064 
- SIGMA.g                   0.00        0.15095371546975E+01        41.0766 
- PI.u          5             0.00        0.17107528424505E+01        46.5520 
- DELTA.g                   0.00        0.17296924532029E+01        47.0673 
- SIGMA.g                   0.00        0.21473825496719E+01        58.4333 
- PI.u          6             0.00        0.23768201813944E+01        64.6766 
- SIGMA.u                   0.00        0.23882601442356E+01        64.9879 
- PI.g          4             0.00        0.27309552208012E+01        74.3131 
- SIGMA.g      10             0.00        0.29220513715690E+01        79.5131 
- SIGMA.u                   0.00        0.35875644510864E+01        97.6226 
- PI.u          7             0.00        0.45717948049858E+01       124.4049 
- PI.g          5             0.00        0.46086261211639E+01       125.4071 
- SIGMA.g      11             0.00        0.50232698743599E+01       136.6901 
- SIGMA.u      10             0.00        0.70389721015058E+01       191.5402 
- SIGMA.g      12             0.00        0.87447280839780E+01       237.9562 
- SIGMA.u      11             0.00        0.15416003867192E+02       419.4908 
- SIGMA.g      13             0.00        0.15780480289142E+02       429.4087 
- SIGMA.g      14             0.00        0.54980526766762E+02      1496.0963 
- SIGMA.u      12             0.00        0.12871833766309E+03      3502.6042 
- SIGMA.g      15             0.00        0.12996513280560E+03      3536.5312 
-</code> 
-上述数据显示 
-  * HOMO为-0.3834 Hartree,LUMO为0.16788680856711E-01 Hartree也就是0.0168 Hartree。对应的eV:-10.4330 eV、0.4568 eV 
-  * 上述数据第一列编号例如SIGMA.g,被称作不可约表示,是代表分子轨道的对称性的,具体含义参考:[[adf:symmetryandrepresentation]] 
-  * 第二列是轨道的序号,不同的不可约表示,各自使用自己的编号 
-  * 第三列数据是该能级的电子占据数,PI.g有一个轨道占据数为4,是因为该能级是二重简并的,因此可以占据四个电子 
-  * 第四列数据是能级能量值,单位为Hartree 
-  * 第五列数据为能级能量值,单位为eV 
- 
- 
-HOMO的能量对应的是IP(离子势),LUMO的能量对应的是EA(电子亲和能) 
- 
-AMS软件提供**免费试用**(一般为一个月),试用申请方式参见**:[[adf:trial|]]** 

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