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adf:emissionofpho

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adf:emissionofpho [2019/11/25 21:45] – [四，得到发射谱] liu.junadf:emissionofpho [2020/12/01 20:23] – [一，计算S0态的频率] liu.jun
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 =====前言===== =====前言=====
-本例介绍从三重激发态（T1）回到基态（S0）的发射谱，该发射谱考虑到了从T1回到S0的各个振动态的分布情况。+本文使用AMS2019.301完成计算。本例介绍从三重激发态（T1）回到基态（S0）的发射谱，该发射谱考虑到了从T1回到S0的各个振动态的分布情况。
  
 参考文献： 参考文献：
行 12: 行 12:
 {{ :adf:emissionofpho01.png?450 |}} {{ :adf:emissionofpho01.png?450 |}}
  
-本文演示如何通过计算，得到该谱图。[[https://www.jianguoyun.com/p/Dax2Xa0QmZ2ZBhijkic|计算文件下载]] +本文演示如何通过计算，得到该谱图。使用AMS2019.301完成。
 =====一，计算S0态的频率===== =====一，计算S0态的频率=====
  
 <color blue>例子文件名：S0_OptFreq</color> <color blue>例子文件名：S0_OptFreq</color>
  
-对基态进行结构优化，并计算频率，参考费米科技维基：[[adf:geoopt]]、[[adf:ir]]。本文中，使用的参数：+对基态进行结构优化，并计算频率，参考费米科技维基：[[adf:geoopt2019]]、[[adf:ir2019]]。本文中，使用的参数：
  
   * 泛函：BP   * 泛函：BP
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 <color blue>例子文件名：T1_OptFreq</color> <color blue>例子文件名：T1_OptFreq</color>
  
-参数设置与S0态的计算一样，唯独修改Spin polarization为2。+T1态结构优化后得到的Bond Energy（-219.63454835 eV）与S0的Bond Energy（-222.12126667 eV）相比，大约高2.5eV，也就是大约20000cm<sup>-1</sup>。这与其他地方得到的实验得到的“T1振动基态”→“S0振动基态”的跃迁符合的比较好。
  
-计算得到的Bond Energy（-219.63454835 eV）与S0的Bond Energy（-222.12126667 eV）相比，大约高2.5eV，也就是大约20000cm<sup>-1</sup>。这与其他地方得到的实验得到的“T1振动基态”→“S0振动基态”的跃迁符合的比较好。+T1态频率计算，参数设置与S0态的计算一样，唯一区别是Spin polarization为2，但是注意采用T1态优化后的结构。
  
 计算完毕，得到T1_OptFreq.t21文件备用。 计算完毕，得到T1_OptFreq.t21文件备用。
-=====三，计算Franck-Condon=====+=====三，计算Franck-Condon Factors=====
  
 用写字板或记事本，创建一个txt文件，内容如下： 用写字板或记事本，创建一个txt文件，内容如下：
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 </code> </code>
  
-创建完毕后，改名为FCF.run，上传到Linux计算。或者直接在Linux创建FCF.run，内容如上。+创建完毕后，改名为FCF.run，上传到Linux计算。或者直接在Linux创建FCF.run，内容如上。命令行进入FCF所在目录，并赋予可执行权限：chmod 700 FCF.run 
 + 
 +Windows上也可以运行，双击运行adf201*.*/adf_command_line.bat打开命令行，输入bash回车，之后就可以像Linux一样使用脚本了，但是当前的目录是adf201*，用户需要通过cd命令，进入作业所在目录，才能运行
  
 注意： 注意：
-  * 该脚本需要在Linux系统运行，目前Windows版不能正常运行该脚本。 +  * S0_OptFreq.t21、T1_OptFreq.t21与FCF.run三个文件，必须在同一个文件夹。运行方式为命令行输入：./FCF.run回车（Windows、Linux均是如此） 
-  * S0_OptFreq.t21、T1_OptFreq.t21与FCF.run三个文件，必须在同一个文件夹。 +  * QUANTA 5 0与STATES对应，设定后者为振动基态（振动量子数为0），前者非振动基态（本例中，振动的激发态最高考虑到第5激发态；如果分子很大，就不需要考虑这么大，而分子如果很小，例如只有几个原子，那么振动量子数可能就很大，比如10、15甚至20），实际上对本例而言，考虑到第4激发态，就已经足够了。如果振动量子数过大，会报错，参考：[[adf:toomanyfactorsoffcf]]
-  * QUANTA 5 0与STATES对应，设定后者为振动基态（振动量子数为0），前者非振动基态（本例中，振动量子数从0到5都考虑；如果分子很大，就不需要考虑这么大，而分子如果很小，例如只有几个原子，那么振动量子数可能就很大，比如10、15甚至20），如果振动量子数过大，会报错，参考：[[adf:toomanyfactorsoffcf]]+
   * TRANSLATE和ROTATE表示考虑平动和转动   * TRANSLATE和ROTATE表示考虑平动和转动
   * SPECTRUM -10000 0 1000表示计算由于振动导致发射峰红移的范围最大10000$cm^{-1}$，最小为0，这个范围内计算1000个数值。   * SPECTRUM -10000 0 1000表示计算由于振动导致发射峰红移的范围最大10000$cm^{-1}$，最小为0，这个范围内计算1000个数值。
 =====四，得到发射谱===== =====四，得到发射谱=====
  
-FCF.run在Linux系统运行完毕，生成FCF.621文件，ADFjobs窗口选中FCF任务，点击SCM LOGO > Spectra（或在Spectra窗口直接File > Open，选择FCF.t61。）即可显示振动对发射的一个展宽谱（下图中的峰展宽修改为200了）：+FCF.run在Linux系统运行完毕，生成FCF.t61文件，ADFjobs窗口选中FCF任务，点击SCM LOGO > Spectra（或在Spectra窗口直接File > Open，选择FCF.t61。）即可显示振动对发射的一个展宽谱（下图中的峰展宽修改为200了）：
  
 {{ :adf:fcf05.png?600 }} {{ :adf:fcf05.png?600 }}
行 80: 行 80:
 {{ :adf:emissionofpho02.png?600 |}} {{ :adf:emissionofpho02.png?600 |}}
  
-发射谱的整体误差，是$E_{T1}-E_{S0}$造成的，而FCF计算看起来是相当准确的，因为谱的形状与实验符合的相当好。+发射谱的整体误差，是$E_{T1}-E_{S0}$的误差造成的，而FCF计算看起来是相当准确的，因为谱的形状与实验符合的相当好。 
 + 
 +计算文件下载：{{ :adf:fcf_pho.rar |}}

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