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adf:cvhd [2021/12/24 13:50] – [优势] liu.jun | adf:cvhd [2023/04/23 17:22] (当前版本) – [CVHD加速方法适用于AMS中ReaxFF、ADF、BAND、DFTB、MOPAC的分子动力学模拟] liu.jun | ||
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* 原子2和原子7~12之间的配位数 | * 原子2和原子7~12之间的配位数 | ||
模拟将生成一个名为HILLS的文件,从中可以读取2D自由能曲面(需要AMS的脚本工具)。 | 模拟将生成一个名为HILLS的文件,从中可以读取2D自由能曲面(需要AMS的脚本工具)。 | ||
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+ | 本文主要介绍HyperDynamics的应用。 | ||
=====CVHD加速方法适用于AMS中ReaxFF、ADF、BAND、DFTB、MOPAC的分子动力学模拟===== | =====CVHD加速方法适用于AMS中ReaxFF、ADF、BAND、DFTB、MOPAC的分子动力学模拟===== | ||
本文介绍基于ReaxFF的分子动力学中,如何调用CVHD达到加速热解反应的效果,在AMS中,也支持其他模块如BAND、DFTB、MOPAC的分子动力学调用该方法进行加速,除去各个计算引擎本身的方法参数设置之外,分子动力学参数、CVHD参数的设置与本文完全一致(图像界面是一致的)。 | 本文介绍基于ReaxFF的分子动力学中,如何调用CVHD达到加速热解反应的效果,在AMS中,也支持其他模块如BAND、DFTB、MOPAC的分子动力学调用该方法进行加速,除去各个计算引擎本身的方法参数设置之外,分子动力学参数、CVHD参数的设置与本文完全一致(图像界面是一致的)。 | ||
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这种加速方法,适用于中等规模的体系:CV相关的键的数量最好在1000个左右,或者更少一些,当然略多一些问题也不大,数量太大CVHD的加速效果就不明显了,因为会太频繁地触发事件,从而限制bias累积速度,进而限制裂解加速效果。 | 这种加速方法,适用于中等规模的体系:CV相关的键的数量最好在1000个左右,或者更少一些,当然略多一些问题也不大,数量太大CVHD的加速效果就不明显了,因为会太频繁地触发事件,从而限制bias累积速度,进而限制裂解加速效果。 | ||
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+ | ChemTrazYer2.0支持基于CVHD模拟的结果的基元反应分析。 | ||
=====分子动力学参数设置===== | =====分子动力学参数设置===== | ||
====模型==== | ====模型==== |