这是本文档旧的修订版!
AMS软件本身并不区分正式版、试用版。对于试用版和正式版的区分,是在license文件,以及法律意义的授权协议上面。因此无论是试用版还是正式版,安装过程都是按照如下步骤:
如果是root用户:将安装包上传到在目标文件夹(例如/public/software/,对于集群来说,必须是装在共享目录下面,也就是说在管理节点上安装之后,其他节点也自动有了),并中解压AMS安装包:
cd /public/software/ tar zxf ./adf2019.101.pc64_linux.platform_mpi.bin.tgz (当然不同的版本,这个文件名也不同)
这样会生成文件夹/public/software/adf2019.101
如果是普通用户:安装包上传到在目标文件夹,例如(/home/UserID),并中解压AMS安装包:
cd tar zxf ./adf2019.101.pc64_linux.platform_mpi.bin.tgz
这样会生成文件夹/home/UserID/adf2019.101
确保ADF2019.101目录对用户具有读、执行权限,如果1,2步是root用户进行解压,则需要执行:
chmod 755 -R /public/software/adf2019.101
如果是普通用户,则跳过即可。
在解压生成的ADF2019.101目录内,有一个文件,名为adfbashrc.sh,用户可以在
export ADFHOME ADFBIN ADFRESOURCES
前面增加一行:
export ADFHOME=/public/software/adf2019.101
说明:
在文件最后增加一行:
export SCM_TMPDIR=/tmp
因此PBS/LSF提交作业的时候,在PBS脚本中增加一句source /public/software/adf2019.101/adfbashrc.sh,具体参考集群、超算:通过PBS、LSF或SLURM脚本提交任务、设定任务核数
如果是SLURM系统,用户可以把这一句写到~/.bashrc文件中,或者由root用户写入/etc/profile文件尾部,之后source ~/.bashrc或source /etc/profile即可。
mkdir /public/software/AMSFloat (注意,浮动目录可以在用户可以读写执行的任何位置,例如普通用户创建到/home/USERID/AMSFloat也可以) cd /public/software/AMSFloat mkdir FloatADF mkdir FloatBAND (如果没有购买BAND模块,就不需要创建FloatBAND) mkdir FloatReaxFF (如果没有购买ReaxFF模块,就不需要创建FloatReaxFF) mkdir FloatDFTB (如果没有购买DFTB模块,就不需要创建FloatDFTB) chmod 1777 Float* ls -lid $PWD/Float*
将产生的一行或几行信息的文本收集起来。注意,Float*目录创建之后,不能改动,删除之后原位置重建也不可以。因此,Float*目录没有放在/public/software/adf2019.101下面,这样以后安装其他版本时,就不需要再提供机器信息,license升级版本后可以直接放入使用
在管理节点,以及几个代表性计算节点(代表性节点指节点名字是一系列的,比如一个集群有100个节点,其中20个节点的机器名叫做node1、node2、node3等;另外有30个节点叫做cn01、cn02、cn03等;还有50个节点叫做compute01、compute02、compute03等。那么需要取的机器信息就是管理节点,以及node1~node3、cn01~cn03、compute01~compute03这些节点)分别运行:
source /public/software/adf2019.101/adfrc.sh dirac info
将这些节点上dirac info命令产生的输出内容,与第5步中产生的信息一起保存为文本文件,作为机器信息。
由注册人邮箱将机器信息发送给费米科技(ams@fermitech.com.cn或相关人员),用于license的申请。
为保护注册用户权益,其他邮箱发送机器信息,需要抄送给注册人邮箱,并由费米科技向注册人邮箱邮件核实,之后才能正式向SCM申请正式许可。一般提交机器信息之后,1~3工作日内会把license发给您,如果3天仍然没有收到,您可以联系我们查询一下进度。
用户收到license.txt文件之后,将该文件放置在ADF安装文件夹(如ADF2019.101)中,之后即可正常使用。
注意:license文件与机器信息绑定,不能随意更换机器,SCM会发给用户一个1年期的license文件,有效期在license文件中可以看到。如果有机器需要更换,在有效期结束、SCM发放新license的一个月前,可以通知费米科技需要更换机器,并把新的机器信息发给SCM或费米科技,那么SCM将会根据新的机器信息生成license,发给用户。
安装过程中有任何问题,可以发邮件到ams@fermitech.com.cn,说明尽量全面的报错的信息,我们将提供有效的协助。