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adf:1hnmrwithssc [2019/12/06 22:04] – [NMR化学位移、自旋-自旋耦合-NMR化学位移] liu.jun | adf:1hnmrwithssc [2019/12/06 23:28] – liu.jun | ||
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行 1: | 行 1: | ||
- | ======NMR化学位移、自旋-自旋耦合-NMR化学位移====== | + | ======NMR化学位移、考虑自旋-自旋耦合的NMR化学位移====== |
使用ADF的图形界面,可以直接对比计算结果与实验结果: | 使用ADF的图形界面,可以直接对比计算结果与实验结果: | ||
行 26: | 行 26: | ||
注意: | 注意: | ||
* 如果只需要计算其中一部分原子的NMR,可以在窗口左边选中这些原子,然后点击右方窗口NMR shielding for atoms后面的➕; | * 如果只需要计算其中一部分原子的NMR,可以在窗口左边选中这些原子,然后点击右方窗口NMR shielding for atoms后面的➕; | ||
- | * 如果只考虑部分原子对某些原子的自旋-自旋耦合,可以分别选中这些原子,在下方的Perturbing atoms和Responding atoms后面的➕ | + | * 如果只考虑部分原子对某些原子的自旋-自旋耦合,可以分别选中这些原子,在下方的Perturbing atoms和Responding atoms后面的➕,Perturbing atoms对Responding atoms进行微扰,用户也可以不勾选上面的元素框,改为一一选择设置 |
* 如果不考虑自旋-自旋耦合,则不设置上图中Spin-Spin Coupling即可。 | * 如果不考虑自旋-自旋耦合,则不设置上图中Spin-Spin Coupling即可。 | ||
* 基组中,J-TZ2P或QZ4P是专用于NMR计算的基组 | * 基组中,J-TZ2P或QZ4P是专用于NMR计算的基组 | ||
行 34: | 行 34: | ||
=====第三步:结果查看===== | =====第三步:结果查看===== | ||
====NMR化学位移、自旋-自旋耦合常数==== | ====NMR化学位移、自旋-自旋耦合常数==== | ||
- | 在*.logfile中,会列出NMR化学位移的值(可以用计算得到的氢谱位移与实验对照,得到平移量,用该平移量来校正所有其他元素、原子的化学位移数据),这里的化学位移没有考虑自旋-自旋耦合;接着列出了原子核与原子核之间的自旋-自旋耦合常数j,如下图所示: | + | SCM - Output - Other Properties - Spin-Spin Coupling |
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====查看$^1$H-NMR谱==== | ====查看$^1$H-NMR谱==== | ||
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- | 这是没有自旋-自旋耦合的结果。每个峰都对应着某个原子,点击这些原子,对应的峰也被选中了。对这个分子而言,中间的两个H原子是等价的,因此可以进行平均:选中左边窗口的这两个H原子,按Ctrl G(或者点击菜单Regions → New Region From Selected Atoms)这样,谱图就对这两个H原子进行了平均。类似地,可以分别对两个甲基上的三个H原子进行平均。从而得到只有三个峰的谱图。 | + | 这是没有自旋-自旋耦合的结果。每个峰都对应着某个原子,点击这些原子,对应的峰也被选中了。对这个分子而言,中间的两个H原子是等价的,因此可以进行平均: |
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+ | 选中左边窗口的这两个H原子,按Ctrl G(或者点击菜单Regions → New Region From Selected Atoms)这样,谱图就对这两个H原子进行了平均。类似地,可以分别对两个甲基上的三个H原子进行平均。从而得到只有三个峰的谱图。 | ||
====查看加入自旋-自旋耦合的$^1$H-NMR谱==== | ====查看加入自旋-自旋耦合的$^1$H-NMR谱==== | ||
行 74: | 行 73: | ||
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- | 回到ADF的谱图窗口,直接ctrl v粘贴这些数据,会弹出提示,问图谱的x值是第几列数据,显然是上面的第1列,图谱的y显然是上面的第2列数据。所以在对话框分别输入1和2即可看到是实验谱和计算谱在同一个窗口了。 | + | 回到ADF的谱图窗口,直接ctrl v粘贴这些数据,会弹出提示,问图谱的x值是第几列数据,显然是上面的第2列,图谱的y显然是上面的第3列数据。所以在对话框分别输入2和3即可看到是实验谱和计算谱在同一个窗口了。 |
还应该修改Coupling后面的频率(默认值为200MHz),本例中,实验上,是用89.56Hz的信号去检测的,因此可以修改为89.56: | 还应该修改Coupling后面的频率(默认值为200MHz),本例中,实验上,是用89.56Hz的信号去检测的,因此可以修改为89.56: | ||
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