这是本文档旧的修订版!
没有图形界面的工作站、没有PBS或LSF的集群:直接运行*.run文件:
*表示文件名,下同。
上传*.run文件到任务目录;
cd 任务目录
dos2unix *.run (如果上传*.run文件使用的是SSH Secure Shell,那么在edit>setting>File transfer>Mode里面Auto Select一项,双击txt,修改成run。那么这一步以后就永远可以跳过了)
chmod 700 *.run
export NSCM=N (N表示您希望的并行数,如果不设置则调用本机所有CPU核)
nohup ./*.run >*.out &
ctrl d退出,之后再关闭命令行窗口。注意,如果不按ctrl d退出,直接关闭命令行窗口,则任务也自动被关闭。
监测计算进度:tail -f /目标文件夹/logfile
运行完毕之后:修改logfile为*.logfile,TAPE21改名为*.t21,out改名为*.out。之后下载到本地Windows电脑进行分析。
强烈地不建议多个任务在同一个文件夹里面进行,而应该为每个任务创建一个文件夹。
如果任务是进行片段分析,参考:fragmenttask