velocity is too large for accurate integration.unable to read the cmd header on the pmi context,Error=1
这是MD过程中,某个原子的速度突然异常高。
如果这种情况如果出现在MD的开始,那就与结构不合理有关,即原子距离太近,MD之前没有弛豫。
如果出现在MD过程中间,那是偶然的一个点,重启计算,绕过这个点就可以了