创建 region,参考:如何创建分区。
完成分子动力学模拟后,在 Movie 窗口,View → Regions 选择需要标记的Region,则这个region会特别显示出来。
这样,Auto_Generated 这个 region (即所有水分子)就特殊地标记出来了。
创建region的时候,选中该元素一个原子,然后Select → Select Atoms of Same Type选中该元素所有原子,然后创建Region。则在Movie中可以类似标记出这种元素的全部原子。
通过Region也可以实现这个功能,只是在创建Region的时候需要相关的功能,详见:如何创建分区