首先应注意Mayer bond order的定义如下：

其中

• A、B为2个原子
• D、S分别为密度矩阵、原子轨道重叠矩阵。在AMSinput → Details → Output Details，勾选Density matrix、SFO overlap matrix，同时AMSinput → Details → SCF → Use old SCF即可输出密度矩阵（基于SFO）、原子轨道（即SFO）重叠矩阵。当然还需要取消对称性（AMSinput → Details → Symmetry → NOSYM），否则重叠积分数值可能不正确。在输出文件中搜索“Pmat-Low”即可看到密度矩阵，搜索“SFO Overlap Matrix”即可看到SFO重叠矩阵
• μ、λ是SFO的编号序号，在AMS计算输出结果中，SCM → Output → Properties → SFO construction可以看到SFO的编号列表

如此，即可分析具体某个轨道重叠，对MBO的贡献大小。