如何进行分区计算：QMMM、QUILD的使用
软件版本为AMS2019.3及之前的版本，AMS2020以后的版本请参考链接：
使用QMMM或QUILD，需要用到ADF的基本功能——分区。区别是：QMMM对某一个区域的原子进行量子力学的计算，而对剩下的区域进行分子力学的计算。QUILD则更灵活一些，可以划分多个区域，调用的方法，也可以ADF、MM、MOPAC、DFTB等灵活调用。
QMMM参数设置
根据需要，对体系进去分区，例如这里把CH3-O-CH3分子分成一个分区，其他所有分子分成第二个分区。分区操作，参考：如何创建分区
切换到QMMM模块，并选择将使用QM方法的分区：
下方出现QMMM、ADF、MM三个按钮，QMMM也就是当前窗口，MM是关于分子力场参数的设置窗口，ADF是QM参数的设置窗口。
QMMM的参数设置：
Task：选择任务类型，例如结构优化、过渡态搜索等； Electrostatic coupling:静电耦合的级别，如果下面的精度、计算量高于上面的选项 Capping method：分区间“结合”的方案
QM部分的参数设置：
可以参考常规的DFT计算参数设置，如：计算HOMO-LUMO、计算紫外/可见光吸收、geoopt等。如果只是结构优化，可以设置如下：
MM区域的参数设置： 其他参数基本上可以使用默认参数，使用的力场可以根据需要修改，ADF自带有两种力场可供选择：Tripos5.2和Amber95。如果用户有其他力场，则通过Force field file选取。
文件保存
保存时，如果是Task选择的是几何结构优化，会提示用旧的优化方法（ADF的优化方法有两种：old，准牛顿法；New（或Auto），共轭梯度法，默认采用后者，但QMMM只能用前者），选择yes。然后保存任务，并运行。如果是单点计算则不会提示。有不同的提示时，千万注意看提示的内容。参数如果设置不合理，保存的时候，会自动提示，修改之后，再保存就不会提示了。因此提示内容是非常重要的。
优化结束，最后优化好的坐标，在*.logfile里面：
-------------------------------- Atom X Y Z (Ang.) -------------------------------- C 0.0000 1.1652 17.8530 C 0.0000 -1.1652 17.8530 O 0.0000 0.0000 17.0445 H 0.8970 -1.2046 18.4980 H -0.8970 -1.2046 18.4980 H 0.0000 -2.0339 17.1838 …… …… H -0.8853 4.5084 17.7247 H 0.4002 7.4539 15.9137 H 1.1445 7.5633 17.5468 H 2.0817 6.9078 16.1773 -------------------------------- <Dec07-2019> <00:18:24> >>>> CORORT <Dec07-2019> <00:18:24> >>>> CLSMAT <Dec07-2019> <00:18:24> >>>> ORTHON <Dec07-2019> <00:18:24> >>>> GENPT <Dec07-2019> <00:18:24> Block Length= 128 <Dec07-2019> <00:18:25> >>>> PTBAS <Dec07-2019> <00:18:25> >>>> CYCLE <Dec07-2019> <00:18:25> |Error| MaxErr Wt(A-DIIS) <Dec07-2019> <00:18:25> 1 0.00352534 0.00111300 <Dec07-2019> <00:18:25> 2 0.00097900 0.00029308 100.0 <Dec07-2019> <00:18:25> 3 0.00051674 0.00015335 100.0 <Dec07-2019> <00:18:25> 4 0.00066823 0.00022374 0.0 <Dec07-2019> <00:18:25> 5 0.00004108 0.00001155 0.0 <Dec07-2019> <00:18:25> 6 0.00001010 0.00000380 0.0 <Dec07-2019> <00:18:26> 7 0.00000110 0.00000024 0.0 <Dec07-2019> <00:18:26> SCF converged <Dec07-2019> <00:18:26> 8 0.00000009 0.00000002 0.0 <Dec07-2019> <00:18:26> >>>> TOTEN <Dec07-2019> <00:18:26> >>>> POPAN <Dec07-2019> <00:18:26> >>>> DEBYE <Dec07-2019> <00:18:26> >>>> AMETS <Dec07-2019> <00:18:26> >>>> POPUL <Dec07-2019> <00:18:26> Bond Energy -1.75765522 a.u. <Dec07-2019> <00:18:26> Bond Energy -47.82823207 eV <Dec07-2019> <00:18:26> Bond Energy -1102.95 kcal/mol <Dec07-2019> <00:18:26> NORMAL TERMINATION <Dec07-2019> <00:18:26> END
可以直接复制这些坐标，在Input窗口直接粘贴即可加入该结构。
QUILD的使用
QUILD的使用与QMMM非常类似，但分区可以更灵活，可以分为任意多个区域，并且每个区域使用不同的方法来处理。
我们对QUILD的主面板进行讲解即可，其他步骤与QMMM完全相同。例如：
主面板中，参数设置也可以参考QMMM计算的参数设置。唯一不同的，在于各个区域计算方法的定义：
- 首先要点击Action前面的“+”，表示挨个定义分区
- 增加第一个区域，选择Total、All，表示全局的计算将使用后面“USE”那一栏定义的计算引擎，例如上图中，表示整个区域，除了那些后面特别定义过的区域，都使用MOPAC
- 增加第二个区域，选择Replace，选定某个区域，例如图中所示选定了一个叫做Region_1的区域，后面USE选择了ADF，那么表示对Methyl区域，使用ADF模块来计算
- Remove那一栏不用填写，在保存任务的时候，系统会自动填写，表示该区域既然已经选择了某个计算引擎，那么全局计算引擎（本例中为MOPAC）在本区域内就不启用了
- 如果有其他区域需要采用其他计算引擎，可以依次分别设置
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