这样往往由于片段计算的作业，不是程序自动生成，而是手工生成造成。碎片作业的原子顺序与主任务中碎片的原子顺序不一样，导致程序无法将碎片与主任务的原子一一对应。

另外，有时候模型中坐标都对应上了，但是仍然有这个报错，这是因为输入坐标在程序开始计算时，程序内部会重新生成新的坐标系，尤其是有对称性的情况下。新坐标系中，出现原子无法一一对应。这在2019以前的版本，偶尔会出现。

可以通过调整坐标系的对称性来解决，把高转动轴设置为z轴，对称中心设置在原点。

2019以后的版本，一般不会出现这种问题。如果有，请将案例文件（*.run与*.out）达到ams@fermitech.com.cn