AMS软件本身并不区分正式版、试用版。对于试用版和正式版的区分,是在license文件,以及法律意义的授权协议上面。因此无论是试用版还是正式版,安装过程都是按照如下步骤(以2022.103版为例,其他版本类似)。
不要在虚拟系统、子系统中安装,运行会不正常。
将安装包上传到在目标文件夹(例如/opt),并中解压AMS安装包:
cd /opt tar zxf ./ams2022.103.pc64_linux.intelmpi.bin.tgz (当然不同的版本,这个文件名也不同)
这样会生成文件夹/opt/ams2022.103。然后执行命令:
chmod 755 -R /opt/ams20*.*
从而赋予该文件夹适当权限:普通用户可以运行程序,但不能修改程序文件。
在解压生成的AMS2022.103目录内,有一个文件,名为amsbashrc.sh,里面包含了AMS所需的环境变量。用户可以酌情考虑是否将临时文件夹从/tmp更改为作业所在文件夹,如果需要,则在该文件最后增加一行:
export SCM_TMPDIR=$PWD
如果是ReaxFF用户,还建议增加一行:
export OMP_NUM_THREADS=1
这个变量是控制OpenMP并行,这个变量用的好,可以提高效率,但是用的不好则会降低效率。如果不想用,则需要在环境变量中将其设置为1。对于高级用户,如果您想使用该变量,请参阅:OMP_NUM_THREADS的运用
source /opt/ams2022.103/amsbashrc.sh export SCM_OPENGL_SOFTWARE=1
将这两行写入/etc/profile尾部,安装完毕,重启机器,如此普通用户就不需要设置环境变量了。
在命令行执行命令:
dirac info
即弹出AMS所需的机器码,将其文本拷贝下来。如果购买了多台工作站的license,在每台安装的工作站上都这样操作,获取机器码。
提交机器码:由注册人邮箱将机器码发送给费米科技(ams@fermitech.com.cn或相关人员),用于license的申请。邮件内容中请说明:单位、注册人、“申请正式许可”。如果不是注册人本人提交,需要抄送给注册人邮箱。一般提交机器码之后,1~3工作日内会把license发给您,如果3天仍然没有收到,您可以联系我们查询一下进度。
注册过正式许可的机器,请勿再次提交。
用户收到license.txt文件之后,将该文件放置在AMS安装文件夹(如AMS2022.103)中,之后即可正常使用。安装过程中有任何问题,可以发邮件到ams@fermitech.com.cn,说明尽量全面的报错的信息,我们将提供有效的协助。
如果这台服务器需要用作图形显示,则可以进行如下设置,否则可以跳过。图形界面的一些默认设置可能并不是我们想要的,例如背景色等。主要的几个可能修改的配置:
用户还可以根据自己的使用习惯,在Preference窗口修改其他默认设置。这些设置是全局生效的,也就是说修改之后,以后打开的窗口都生效。另外,用户还可以SCM LOGO > Preference > Colors > Atom Colors 修改原子的颜色等等
初级用户,为了避免资源浪费,事半功倍,请务必花几分钟时间阅读:Linux、Windows桌面系统:使用图形界面提交任务、指定任务核数