本教程基于软件版本AMS2019.301，本文以$H_2$的计算为例进行演示。

首先进行正常的建模、参数设置，并保存任务：

生成的*.run文件（可以用写字板或记事本，或其他文字编辑器打开）有如下一段：

    Atoms
    1 H       0.307227424127      -0.353311537746       0.000000000000    
    2 H       1.047227424127      -0.353311537746       0.000000000000    
    End

这是描述原子与坐标的。将要修改为同位素的原子通过添加后缀的方式改名，并指定其原子量。格式如下(有一个原子改为了H.d，并指定它的原子量为2.014)：

    Atoms
    1 H       0.307227424127      -0.353311537746       0.000000000000    
    2 H.d       1.047227424127      -0.353311537746       0.000000000000    
    End
 
    AtomProps
    H.d m=2.014
    end

修改完毕，保存该文件，然后直接运行该任务即可。该体系即氕-氘。

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