分区设置不正确,有可能有的分区里面,没有原子。在Model > Region中勾选某个分区,这个分区的所有原子会显示为彩色光晕,如果勾选该分区,没有原子出现这种效果,那就表示该分区没有原子。
分区操作,参考:如何创建分区