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adf:imagefreqoffranck-condonfactors

如何去掉Franck-Condon Factors计算的一些虚频和低频模式

前言:

对于比较大的分子体系,我们有可能会为了减小计算量,在优化结构的时候,固定某些原子。这样会带来导致计算频率的时候,产生一些虚频;有时候即使优化的很好,也会得到一些波数很小、振幅也很小的频率,其中有的波数很小的频率其实是平动,而虚频则是负数,我们计算Franck-Condon Factors(FCF)的时候,并不希望把这些频率考虑进去。

解决方法:

ADF计算FCF的时候,会自动去掉波数(绝对值)很小的振动模式,但并不会自动去掉虚频。那么我们要去掉虚频以及很小的频率的时候,就可以通过MODES关键字来指定需要计算的频率范围。以下为一个例子:

我们以甲醛为例,分别计算了两种状态下的甲醛分子的振动。分别得到12个振动模式,

FCF的*.run文件如下:

$ADFBIN/fcf << eor
STATES D:\ADF_DATA\w1.t21 D:\ADF_DATA\w2.t21
QUANTA 0 0
MODES 8 10
eor

注意此处QUANTA 0 0表示计算涉及振动模式都只考虑振动基态,实际计算的时候,不能设置为0。

那么我们看FCF计算的*.out文件:

那么事实上,对于两个状态的甲醛分子,都只纳入了第2、3、4个振动模式。那么我们现在详细说明MODES的后面的数字的含义:

MODES M N表示计算两个状态的分子分别从第M-6到第N-6个振动模式。

如果分子中的原子个数为2或者3,则表示计算两个状态的分子分别从第M-3到第N-3个振动模式。原子个数为1,实际上就没有振动谱,也谈不上FCF。

6和3,实际上表示这个分子具有的6个或者3个平移运动,波数实际上为0。

ADF软件提供免费试用,试用申请方式参见费米科技维基百科:AMS免费试用

adf/imagefreqoffranck-condonfactors.txt · 最后更改: 2022/01/20 16:26 由 liu.jun

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