片段结合之后,片段的电子密度有所变化,也就是:总电子密度-每个片段单独存在时的电子密度之和。这可以描述结合的过程中,电子的流向。在BAND中,只要进行了EDA计算,具体参考:
计算完毕之后,
Add > Isosurface > 之后在窗口下方Select Field选择:Density > Total Density则显示体系的总的电子密度分布。
SCM LOGO > View,点击Add > Isosurface: With Phase,之后在窗口下方Select Field选择:Fragment Related Density > Deformation density w.r.t Sum-of-FragmentS,可能几分钟时间计算之后,将会显示形变差分密度。
表示总密度减去分区孤立存在时的密度,其蓝色区域表示正值,红色区域表示负值。