聚合物建模
版本要求不低于AMS2020.101。本文以高抗冲聚苯乙烯（HIPS）为例演示AMS的聚合物建模功能。
HIPS是一种低成本、易生产、易加工、低强度、抗冲击的热塑性塑料，是一种接枝聚合物，主链为聚苯乙烯，各向分支为聚丁二烯链。
一、单一组分聚合物建模
1，导入单体、设置“连接点”
这里以纯的聚苯乙烯为例进行演示。AMSinput → Edit → Polymer… → Add monomer:输入styrene，窗口左边出现苯乙烯单体：
其中1A、1B是苯乙烯的两个连接点，形成聚合物时，各个单体间通过这两个点连接形成聚合物。
用户也可以选择其他H原子作为连接点：选中H原子，点击窗口右边的“Set link point”旁边的“Replace”按钮，该H原子就成为了新的连接点。下面的步骤中，用户可以根据需要指定连接方式。
用户也可以自建单体：在AMSinput中，创建分子或通过File → Import Coordinates导入分子均可。然后自定义“连接点”即可进行后面的操作。
2，设置连接方式
设置聚合物的单体数量：Mononmer repeats输入单体数量，例如200，则生成的聚合物包含总共200个单体。
点击“Links”旁边的➕，选择连接方式，例如：
权重是描述这种连接方式，在聚合物中的占比。用户只要输入相对比例即可，程序会自动计算百分比。例如这里只有一种连接方式，所以默认weight为1。如果有多种连接方式，如果各种占比相同，则可以都用默认weight：1。用户可以灵活调整该数值为正数即可。
随机性：勾选Random seed选项，程序会自动随机地生成聚合物结构。当然对于纯的聚苯乙烯而言，确定了两个连接点，实际上就没有随机性了。但是有多种组分的时候，随机性就会发生作用了。
点击“Generate”按钮，窗口中将生成200个单体的聚苯乙烯：
3，使用力场优化分子结构
点击“Close”按钮，关闭建模窗口，切换到Force Field模块优化分子结构：
File → Save as保存并运行任务。任务结束后，窗口弹出是否更新分子结构的提示，点击yes，将得到合理的聚合物分子结构。提交任务更详细的设置，参考：正式版的安装、维护与升级
二、HIPS的建模
1，导入单体、设置“连接点”
打开AMSinut，如上类似的方式，导入styrene、1,4-butadiene，或者用户自建这两个分子，或通过File → Import Coordinate导入两种分子。导入之后，用鼠标右键将两个分子拖开，便于分别设置两个分子。创建、选中、移动分子等基本操作，参考：AMS的基本建模功能（视频）
2，设置连接点、连接方式
通过“Add Monomer”按钮导入的单体，默认包含两个连接点。HIPS的支链是从苯乙烯末端C原子生长，因此该C原子上的另外2个H也可以设置为连接点（分别叫做1C、1D，当然如果是用户自建或通过File → Import Coordinate导入的分子，连接点全部需要用户设置，名字的顺序不太一样，但是不影响这个过程）：
并设置连接方式如上图所示。1A与1B连接，形成聚苯乙烯主链，1C、1D与2A连接，形成两个方向的支链，2A与2B连接，让支链生长。因为不希望支链太长，所以Weight的设置上，2A-2B连接的权重设置的很低（0.1）。
单体的总数目设置为300，如上图所示。勾选了Random seed，因此每次创建的模型，可能都不一样，是随机的。
设置完毕，点击“Generate”按钮，则逐渐生长出聚合物，最终生成总共300个单体的聚合物。
切换到UFF模块，并优化结构，得到聚合物：
三、聚合物固体的建模
如上只是建立了聚合物分子，从聚合物分子生成固体，需要先创建低密度分子混合物，然后逐渐将其压缩。之所以创建低密度分子混合物，是因为采用Packmol随机刚性堆叠时，分子的间距是有要求的，一般分子间最小距离不小于 2.5 Å，因此刚性堆叠并不能生成高密度体系。