这是本文档旧的修订版!
视频教程的补充说明:
范例中,使用dftb,不断缩短lattice,不优化lattice的条件下优化聚合物,这一步中,如果固定需要等价原子(在本例中是氧原子),效率更高,可靠性也更好。
在得到较为可靠的结构之后,可以释放对氧原子的固定、释放对lattice的限制,让体系处于不受外力限制的状态下进行优化。
MOPAC模块固定原子的操作:details-Geometry optimization。在左边窗口选中需要固定的原子,然后在右边窗口的Freeze atoms点击“+”,则将左边选中的原子固定(选中原子后,点击“-”是取消该选中原子的固定)
DFTB模块固定原子的操作:Model-Geometry Constraints。在左边窗口选中需要固定的原子,然后在右边窗口的Freeze selected atoms点击“+”。“-”号表示取消固定。