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adf:bsseofband

这是本文档旧的修订版!


Ghost原子的设置与使用(用于周期性体系的BSSE修正)

周期性体系的BSSE修正,原理与ADF模块一致,参考bsse

BAND模块的*.run文件坐标格式

默认生成的*.run文件,坐标格式是类似这样的:

ATOMS H
0.04893625887 0.1606329772 -0.4241884865
0.6266772729 -0.1917748773 -0.7235612053
END
 
ATOMS O
2.639585644 0.7559731921 1.28755038
2.199232799 0.1119645919 0.01812440903
END

也就是将某一种元素列出来,然后列出该元素原子的坐标,例如上例中是2个O原子和2个H原子。

要设置Ghost原子,需要手动整理一下坐标格式,修改成如下的格式:

ATOMS 
H 0.04893625887 0.1606329772 -0.4241884865
H 0.6266772729 -0.1917748773 -0.7235612053
O 2.639585644 0.7559731921 1.28755038
O 2.199232799 0.1119645919 0.01812440903
END

简单的说,就是在ATOMS字段内,把所有原子都列出来,第一列标记元素符号。

Ghost原子的设置

例如上例中,我们希望将第二、三个原子设置为Ghost,那么只需要将上述坐标改为:

ATOMS 
H 0.04893625887 0.1606329772 -0.4241884865
Gh.H 0.6266772729 -0.1917748773 -0.7235612053
Gh.O 2.639585644 0.7559731921 1.28755038
O 2.199232799 0.1119645919 0.01812440903
END

即可。 也就是在希望改成Ghost原子的原子前面加上'Gh.'标记。如此,该原子就实际上不存在,对整个体系的影响,就仅仅是提供了一个该原子的基函数。

adf/bsseofband.1567149537.txt.gz · 最后更改: 2019/08/30 15:18 由 liu.jun

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