任何一个计算中,包括分子动力学、单点计算,均默认得到原子的电荷。查看方式:
SCM LOGO > Output > 搜索“Mulliken Charges”:
---------------- Mulliken Charges ---------------- Index Atom Charge Population 1 C -0.2556846093 4.255685 2 C -0.1173914561 4.117391 3 C -0.1175130990 4.117513 4 C -0.2556737553 4.255674 5 H 0.0805156239 0.919484 6 H 0.0762315658 0.923768 7 H 0.0803866079 0.919613 8 H 0.0679999623 0.932000 9 H 0.0680146287 0.931985 10 H 0.0680852067 0.931915 11 H 0.0681320550 0.931868 12 H 0.0763849364 0.923615 13 H 0.0803195190 0.919680 14 H 0.0801928141 0.919807 Total 0.0000000000 26.000000
在SCM - View - Properties - Atom info - Atomic Charge即可查看(两种Atomic charge结果是一样的,都是Mulliken charge)
结果查看:
SCM - KF Browser - File - Expert Mode - MDHistory - Charge(i),其中i是帧数。 直接列出了电荷数值,是按原子排序来排列的。在AMSinput - Model - Coordinates里面的顺序,也可以File - Export Coordinates导出xyz文件,顺序也是一致的。