ADF中的原子编号是按照坐标的顺序来排列的。因此在坐标列表文件中，原子的顺序就是原子的编号。在ADFinput中，也可以通过鼠标操作，修改排序：

在ADFinput > model > coordinates列表中，双击对应的原子坐标行，或者在左边窗口中，直接用鼠标选中某个原子或多个原子，然后点击右边窗口红色方框所示的move atom(s) up或move atom(s) down，从而原子的调整其顺序。