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adf:分子结构的对称性与结构优化

分子结构的对称性与结构优化

如果分子结构可能具有对称性,但我们并不确定,那么应该如何优化?

1)初始结构建模的时候,尽量往自己估计的对称性靠,可以借助ADFinput下方的五角星工具去自动往对称结构靠,然后再优化。优化过程会自动保持这种对称性,甚至自动提高到更高对称性——倘若那样能量更低的话。

2)初始结构保持没有对称性,优化之后,如果对称结构能量更低,则自动得到对称性的结构。

优化结束之后,可以再优化一遍。因为在1)或2)优化的过程中,使用的点群偏低。如果经过1)或2)的优化,分子已经变得更对称了,那么重新优化的时候,程序可以自动按照实际的高的点群,再优化一遍,这样会很快结束优化,结构也更标准。

例如<chem>CO2</chem>,初始结构如果是一个Cs群的结构,ADF优化之后,可以得到一个非常非常接近D∞h的结构,例如键角可能会是179.8度(其他软件一般很难得到这样的结果,根源在于这些软件对能量梯度的计算不精确),但优化过程程序,程序还是将其做Cs群处理。如果用这个结构再优化一遍,程序就自动按照D∞h处理,因此能够得到180度键角的结果。分子轨道也按D∞h的不可约表示排列。

adf/分子结构的对称性与结构优化.txt · 最后更改: 2016/04/07 21:17 由 liu.jun

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