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adf:函数空间分布在view显示中阶段的问题

这是本文档旧的修订版!


函数空间分布在view显示中截断的问题

对于显示而言,截断是必须的。否则程序无法实现显示无穷远处的数值。它总是有个范围的。只显示那个范围的情况。这个范围是一个方形区域,边界取所有原子的坐标沿该方向的“最大值”加上一个常数。换句话说,是做一个矩形区域,将分子全部包含进去,同时留一定的空闲。例如是计算的HF:

等值面的值取的0.0003,可以很清晰地看到这种“边界”。

那么为了撑大这个边界,我添加了两个H原子鬼原子(即基函数使用H的SZ,但既不贡献原子核也不贡献电子,如果担心这些波函数对结果有影响,可以认为的修改H的SZ,把指数设置为非常大的数值,这样衰减就非常快,只影响鬼原子核附近极近的区域。注意需要将该基函数另存到其他位置,避免以后真正使用H原子SZ的时候混淆。设置基函数的时候,需要单独为鬼原子指定该基函数),放置于离现在分子10埃的位置,这个时候,这个边界就被撑大了:

甚至显示更小的等值面:

等值面的数值为0.0000003,可以看到在鬼原子存在的方向,没有“截断”。没有鬼原子的方向,已经有了截断:

鬼原子的用法、意义,详见如何计算bsse

adf/函数空间分布在view显示中阶段的问题.1432690542.txt.gz · 最后更改: 2015/05/27 09:35 由 liu.jun

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