这是本文档旧的修订版!
ADF2016以后的版本,支持周期性体系的能量分解。以下以体心立方的铁晶体孔状结构吸附H2例。
在免费、开放的美国矿物晶体在线数据库可以搜索到体心立方铁的晶体结构文件,下载*.cif格式的结构文件。
创建孔洞结构的过程,参考创建孔洞结构。
点击如下图黄色圆圈所示的H符号,点击孔洞内的空间两次,则创建好了H2。按CTRL m键,则选中了整个H2分子。将H2移动到合适的位置,参考AMSinput常用快捷键、精确调整键长、键角、二面角、显示键长、键角、二面角。
当然,真正进行计算的时候,需要进行结构优化。但本例中仅演示能量分解的功能,因此省去了结构优化的步骤。
设置参数如下:
泛函、基组的选择,可以参考不同泛函的特点、ADF:一般情况下如何选择基组Basis Set、对同一种元素的不同原子指定不同基组
为能量分解设置片段区域,设置方法,如果没有做过的话,务必参考如何创建分区
对于pEDA而言,只需要关心Gamma点就可以了,所以k点设置如下(或者K-Space选择Gamma Only也可以):
设置完成后,File > Save As,保存任务。
提交任务的方式,参考parallel
查看结果文件,参考结果文件查看。
打开*.out文件,点击Properties > PEDA Energy Terms即可看到能量分解的情况。各项能量的含义,请参考pEDA能量各项的含义。