这是本文档旧的修订版!
BAND的一维是真正的一维体系,不需要加真空。本例以碳纳米管内吸附H2为例说明pEDA的使用。
ADF本身没有创建纳米管的功能,可以使用VNL(免费,可以在费米科技官网在线申请),很轻松的创建碳纳米管等模型,注意设置管的朝向为x轴方向。创建完毕之后,Export为CIF文件。ADFinput中,File > Coordinates Import导入,之后将Main菜单中Periodicity充Bulk(表示三维)改为Chain(表示一维)。
然后CTRL A 选中所有原子,通过Edit > Crystal > Set Cell Center,以及Edit > Crystal > Map Atoms To Unit Cell将纳米管放置在Cell中心:
点击窗口下方的“H”按钮,在Cell中心区域,连续点击两次则创建好了H2分子。调整到合适的位置,参考AMSinput常用快捷键、精确调整键长、键角、二面角
为能量分解设置片段区域,设置方法,如果没有做过的话,务必参考如何创建分区
提交任务的方式,参考并行数的设置
查看结果文件,参考结果文件查看。
打开*.out文件,点击Properties > PEDA Energy Terms即可看到能量分解的情况。各项能量的含义,请参考pEDA能量各项的含义。