导入图像-新项目

导入体积图像是加载一个包含像素值的文件（或一组文件）的过程，但不包含所有“关键”数据表示信息，比如间距（原始图像数据）、体积大小（像素）、序列名称（DICOM）等。为了导入体积图像，必须指定这些值。

导入 Simpleware ScanIP 的常见图像数据格式是原始图像格式、图像堆栈、DICOM 图像和空白图像。点击 File — New project，选择您的图像文件类型。

• DICOM images：通常是医学图像
• DICONDE images：通常是工业图像
• Stack or raw images：BMP、JPG、PNG、TIFF、RAW、IMG、VOL等
• 3D image formats：HDR、MHD、MHA、NII…
• Blank image：生成一个具有空白图像背景的项目文件

同样地，您也可以在打开软件后欢迎页面的 New project from 区域点击相关选项导入图像数据。

选择 Stack or raw images 可以导入 2D 图像堆栈、3D 原始图像或原始图像堆栈。

在一组 2D 图像文件的数据中，每个切片就是一个图像文件，由使用的图像格式给定像素类型。切片的数量（在 X、Y、Z 方向）也隐含给出：

• 由每个切片的尺寸给定在 X 和 Y 方向的像素数量（如 2D 图像文件）
• 切片数量（如在 Z 方向的像素数量）等同于图像文件的数量

其他需要的信息和必须包含：

• 以 mm 为单位的所有方向上的间距（分辨率）

导入图像堆栈：

• 点击 File — New project — Stack or raw images 或在欢迎页点击 Stack or raw images。
• 显示 Import images 对话框，点击 Select File(s)… 或 Select folder…，选择保存图像堆栈的路径。
• Simpleware ScanIP 将在 File 表中显示提取的图像堆栈。
• 如果需要单独删除切片可以选中 File 栏的一个切片并点击 Remove Selected Slice。
• 通过点击 Move Selected Up、Move Selected Down 按钮或按字母排列文件确定切片的正确顺序。
• 输入 Spacing 数值。
• 点击 OK。
  • （可选）如果点击 Use advanced import options，将会出现 Crop and resample 对话框。

原始图像数据通常是一个包含图像每个像素/体素值的单一文件，但也可以是以堆栈的形式。描述数据的附加信息是必要的，可以是文本文件，也可以是电子邮件等提供的一些信息等。附加信息必须包括：

• 像素类型（如 unsigned byte、16-bit、float）
• 每个方向（X、Y、Z）的像素数
• 每个方向（X、Y、Z）的间距（真实单位的尺寸，如 mm、m等）

导入原始图像文件：

• 点击 File — New project — Stack or raw images 或在欢迎页点击 Stack or raw images。
• 显示 Import images 对话框，点击 Select File(s)… 选择原始文件。
• 填写合适的参数：Pixel type、Pixel Size、Number of slices、Spacing、Offset to first slice (bytes)。
• 选择合适的 Byte order (Big endian 或 Little endian) 和 File type(Binary 或CSV)。
• 选择 File type，这里可以指定原始图像文件为 ASCII 或 Binary 格式。
• 点击 OK。
  • （可选）如果点击 Use advanced import options，将会出现 Crop and resample 对话框。

Offset to first slice（bytes）参数用于跳过前面一定数量的输入文件，跳过的信息包含任何元数据，如输入文件中关于分辨率、帧数的附加信息。

CSV 输入文件应包含由空格、括号或任何非数值分隔的数值，第一个分隔符后面的分隔符字符数不受限制。

Byte order：根据使用的计算系统，多字节数字在原始图像文件中的存储方式将由字节顺序（即小端序或大端序）决定。通常，PC 使用 Little endian 字节顺序，而某些 Apple Mac 使用 Big endian 字节顺序。字节顺序参数与 CSV 文件无关，在原始导入对话框中显示为灰色。此外，CSV 文件不支持文件长度检查字段。

原始图像数据通常是一个包含图像每个像素/体素值的单一文件。数据也可以作是一组 2D 原始图像，堆栈中的所有原始图像都具有相同的必要附加信息。

导入原始图像堆栈：

• 点击 File — New project — Stack or raw images 或在欢迎页点击 Stack or raw images。
• 显示 Import images 对话框，点击 Select Files… 或 Select Directory… 选择保存的原始图像堆栈。
• Simpleware ScanIP 将在 File 表中显示提取的图像堆栈。
• 如果需要单独删除切片可以选中 File 栏的一个切片并点击 Remove Selected Slice。
• 通过点击 Move Selected Up、Move Selected Down 按钮或按字母排列文件确定切片的正确顺序。
• 输入 Spacing 数值。
• 填写合适的参数：Pixel type、Pixel Size、Offset to first slice (bytes)。
• 选择合适的 File type 和 Byte order。
• 点击 OK。
  • （可选）如果点击 Use advanced import options，将会出现 Crop and resample 对话框。

选择 3D image formats 可以导入包含创建 Simpleware ScanIP 项目需要所有信息的体积图像文件类型（如 *.hdr 文件）。可通过点击 File — New project — 3D image formats 或欢迎页的 3D image formats 打开以下体积图像文件格式：

• Analyze image (*.hdr)
• Interfile image (*.hdr)
• Meta image (*.mha; *.mhd)
• NIFTI-1 image (*.hdr; *.img; *.nii; *.gz)

导入 3D 图像格式：

• 点击 File — New project —  3D image formats 或在欢迎页点击 3D image formats。
• 选择图像文件的保存路径，点击 Open。

• Simpleware 软件内置手册 Simpleware ScanIP–Loading and saving images / Importing images-New project