使用Job Manager向服务器上提交作业

概述

Job Manager支持设置设置远程服务器提交任务，该方法的特点是：

安全：仅使用SSH端口的加密通信；服务器端无需后台进程，无需单独开放其他端口，有效保障安全性，特别适合公共服务器上部署计算；
简单：支持自动创建任务文件夹和提交脚本，不需要终端登录服务器进行任务提交；
强壮：任务成功提交之后，即可断开与服务器的连接；不必担心网络问题造成的计算中断；无后台进程、数据库等复杂配置，更强壮；
便捷：随时可以联机查看即可查看任务、下载计算结果。

要使用Job Manager直接向服务器提交计算，需要先进行一次远程服务器连接配置。从2017版开始，设置使用Job Manager向服务器提交作业变得格外方便。详情请参见：设置用于计算的远程服务器。

提交新计算作业（计算使用 New Calculator）

如果以上设置没有问题，可以尝试提交任务。将作业脚本发送至job manager，选择相应的队列，点击开始按钮即可开始提交计算。计算一旦开始排队或运行，VNL即可关闭，并断开网络连接。下次连接时，VNL会自动检测作业进度并下载文件。

自定义任务的计算设置

在提交任务时，用户仍有机会修改每个提交任务的计算设置，方法是：

向队列提交任务后不立即点击“开始运行按钮”，此时可以点击 Job Setting 按钮修改计算设置：

在Resource选项卡中可以临时修改此计算任务的计算资源（与上面队列设置类似）：

提示

于为了防止重名覆盖，Job Manager 会在设定的目录下自动为每个作业生成随机的文件夹名称（格式为提交日期和随机字母组合），这为用户手动查找作业目录带来了一定的麻烦。为此，建议在提交任务时，为每个作业添加一个有意义的子目录（如上图中作业队列默认的目录为/home/ddong/atkjobs，提交任务时可以要求job manager 创建子目录 sic_bandstructures），这样便于管理计算作业的文件夹。

提交续算作业（计算使用了Analysis from File）

通常情况下，程序能自动识别Analysis from File，并正确上传相关文件到服务器文件夹，以备计算使用。
但仍建议用户在提交作业后，开始运行作业前，除计算资源、并行设置外，用户还应检查，所需的hdf5文件上传列表：

计算结果的回传

作业成功开始排队或计算后，图形界面端即可关闭、断开。下次打开图形界面时，软件自动连接服务器检查作业状态，如果自动检查或下载数据失败，可以在 Job Manager 中使用 Recover Data 来强制回传结果。必要时终端登录服务器检查作业状态。

问题排除

提交任务遇到问题时，需要针对具体问题编辑设置。

提交任务的PBS脚本的详细设置请参考：通过命令行方式手动提交QuantumATK计算。