velocity is too large for accurate integration.unable to read the cmd header on the pmi context，Error=1
这是MD过程中，某个原子的速度突然异常高。
如果这种情况如果出现在MD的开始，那就与结构不合理有关，即原子距离太近，MD之前没有弛豫。
如果出现在MD过程中间，那是偶然的一个点，重启计算，绕过这个点就可以了