AMSJobs → Queue → New → PBS,设置如下:
Queue Name:队列的名字,不能包含中文字符、空格,提交作业的时候,选取该队列,即使用该队列提交作业,例如这里设置为4核队列,那么提交的作业使用4核运行
Remote host:集群提交作业的节点IP(如果是在管理节点打开GUI此处填写机器名/IP都可以)
Remote user:登陆集群的用户名
Path to private ssh key:保存私钥的完整路径,注意不要包含中文、空格。有的版本里面,没有这一条,就不需要设置
Remote job directory:作业在服务器上保存的位置,要求用户对该路径有读、写、执行的权限,如果在用户自己的空间下则不存在这个问题
Run command:这是需要特别注意的,用户应该首先咨询管理员提交作业的命令,例如管理员提供的提交作业的命令为:bsub -lnodes=2:ppn=2 123.sh,那么此处填写bsub -lnodes=2:ppn=2 -J `basename “$job”` -M 1048576 $options < “$job”
Prolog command:source命令后面是服务器上安装的ams文件夹内的amsbashrc.sh的完整路径
其他不需要修改