重力场下的分子动力学

常规分子动力学作业保存后,生成*.run文件。用写字本打开该文件,在MolecularDynamics这个字段中添加子关键词:

    Gravity
      Acceleration 0.98e-23
    End

看起来是这样:

...
MolecularDynamics
    NSteps 50000
    InitialVelocities
        Temperature 300
    End
    Thermostat
        Type NHC
        Temperature 300
        Tau 100
        Region Region_1
    End
   Gravity
      Acceleration 1e-21
   End
End
...

修改完毕,保存后,AMSJobs → Job → Run提交作业。

切勿在AMSinput → File → Run,因为这样的话,会重新保存一次图形窗口的参数,把刚刚添加的内容又清空掉了。