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以聚乙烯为例,演示低维周期性体系的结构优化

创建模型,并使用MOPAC或DFTB进行粗略的优化

DFTB结构优化参考:使用DFTB进行晶体结构优化

MOPAC优化设置则更简单:Task选择Geometry Optimization即可。同时注意Periodicity的设置正确(Bulk、Slab、Chain、None表示三维、二维、一维、非周期性边界条件)

使用DFT(BAND模块)进行优化

参数设置如下:

因为这个体系是一维周期性的体系,因此上图中周期性设置为Chain,如果是二维体系,该选项为Slab,三维为Bulk。泛函选择了Libxc,因为libxc泛函支持解析梯度优化晶格常数。

libxc输入PBE,即使用Libxc:PBE,也可以是其他泛函。

如果单胞的尺寸有可能不准确,需要优化,可以增加如下设置。如果是表面吸附、掺杂,一般不需要做单胞的优化,可以跳过该设置。

提交任务,参考:正式版的安装、维护与升级

结果查看

SCM LOGO > movie,查看收敛过程:

优化完毕,弹窗提示是否将新坐标更新大Input,点击Yes,自动更新到Input以便进行下一步计算。

总能量值

优化得到的能量,在SCM → logfile打开*.logfile,在文件尾部可以看到ENERGY OF FORMATION即总能量。