如何固定某些原子的坐标中z值

正常建模、参数设置之外,需要增加如下设置:

  1. Model → Geometry Constraints and PES Scan,选中要固定的原子,点击Fixed x前的+按钮,则表示固定x值,类似可以固定y、z
  1. 在生成的*.run中增加类似如下字段:
    Constraints
       COORD 1 x -1.904810029589
    End

其中

因此上述设置的意思是:固定第一个原子的x坐标值为-1.904810029589

例子:

......
System
    Atoms
        O -1.492033059023336 -0.5659435741122993 0.0 
        H -1.524616589029579 0.3655984700676023 0.2297122841675266 
        H -1.394282469004606 -0.6578949321323736 -0.950573390070043 
    End
    BondOrders
         2 1 1.0
         3 1 1.0
    End
End
Constraints
    Coordinate 1 x
    Coordinate 1 y
End

Engine BAND
    XC
        LDA SCF VWN
    End
EndEngine
......