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如何计算电子密度的空间分布

本文所使用的软件版本AMS2020.101。

第一步,结构优化

参考:优化分子的几何结构(此处以O2分子为例,其他分子类似)

第二步,单点计算

参考:单点能计算、HOMO、LUMO、IP、EA的计算、分子轨道的成分(链接中使用案例为二氧化碳,其他分子类似)

第二步,查看结果

SCM - View - Add - Isosurface,窗口底部Select Field选择Density - Density SCF,即可显示电子密度:

设置电子云密度的等值面透明度,参考:如何设置View中各种空间分布图的透明度

也可以通过截面,用颜色来表征电子密度的变化:Add - Cut plane:Colored,然后根据三个点确定一个平面的原则,选中三个原子,点击窗口底部的with atoms按钮,该截面将通过这三个原子。同时取消前面等值面前面的勾选,只显示截面图:

勾选右下角的bar,显示不同数值与颜色的对照关系,其范围可以在窗口底部设置,例如上图中范围是:2.1*10-6 ~ 0.25。因为density的数值变化很剧烈,因此默认取了log函数再显示。如果去掉该勾选,则显示直接的密度分布。

如果是开壳层体系,则可以类似如上的方法,分别显示Spin α、Spin β的密度(即Density - Density SCF A以及Density SCF B)。可以将二者加和并显示出来,加减运算操作参考:View中如何进行函数的加减等运算

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