软件版本为AMS2019.3及之前的版本,AMS2020以后的版本请参考链接:COSMO、SCRF溶剂化的计算
在使用的时候,例如结构优化、光谱计算、过渡态计算等等,只需要在原先不考虑溶剂化的基础上,增加如下所示的设置即可。
这是ADF的两种设置最简单的溶剂化,也是最常用的溶剂化方法。
COSMO溶剂化模型如上图所示,选好溶剂化理论以及溶剂即可。其中Solvent epsilon和Solvent radius不需要设置——除非在溶剂列表中没有该溶剂。
SCRF的溶剂化,需要设置Default radii为Noodelman。
COSMO的溶剂化能,参考:ADF计算溶剂化自由能(Free Energy of Solvation)
SCRF的溶剂化能,在out文件的尾部,搜Net可以搜到,Net即表示溶剂化能,例如:
ANALYSIS (Energy in kcal/mol) Cycle Cost Gainr GainP Net EleDip ------------------------------------------------------------ 0 0.00 -24.16 0.00 -24.16 -24.165 1.2979 1 7.69 -41.82 0.00 -41.82 -34.126 2.2712 2 13.94 -48.54 0.00 -48.54 -34.595 2.9494 3 17.07 -51.57 0.00 -51.57 -34.500 3.4460 4 18.73 -53.13 0.00 -53.13 -34.402 3.8248 5 19.64 -53.98 0.00 -53.98 -34.342 4.1198 6 20.15 -54.45 0.00 -54.45 -34.300 4.3551 7 20.45 -54.73 0.00 -54.73 -34.279 4.5462
其中第6列数据Net即表示在SCRF的迭代过程中,溶剂化能的不同值,最后一次为-34.279kcal/mol。
SCRF搜索Net会有多个,因为SCRF本身是一个自洽迭代的过程,因此会多次计算溶剂与溶液,直到达到平衡。在out文件中,也会对应的出现多次类似上诉内容,以最后一次出现的为准(最后一次出现的,才是收敛的结果)